Klinik örneklerden izole edilen Candida glabrata kompleksi suşlarının moleküler yöntemlerle tür düzeyinde tanımlanması ve antifungallere duyarlılıklarının belirlenmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: İstanbul Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, İstanbul Tıp Fakültesi Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2023
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: YASEMİN AYŞE UÇAR
Danışman: Gonca Erköse Genç
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Candida glabrata insanlarda gastrointestinal sistem ve mukokutanöz membranların mikrobiyotasının üyesidir. Risk faktörlerinin varlığında fırsatçı enfeksiyonlara neden olmaktadır. Suşlarda flukonazole direnç veya azalmış duyarlılık görülebilmekte, son yıllarda ekinokandinlere direnç gözlenme sıklığında da artış bildirilmektedir. İki yeni tür olan Candida nivariensis ve Candida bracarensis, C. glabrata sensu stricto ile birlikte C. glabrata kompleksi içinde sınıflandırılmaktadır. Bu iki yeni tür yüzeyel ve invazif çeşitli enfeksiyonların etkeni olarak izole edilmiş, C. glabrata'ya göre daha dirençli ve virülan oldukları belirlenmiştir. Ancak fenotipik ve biyokimyasal yöntemlerle C. glabrata'dan ayırt edilememekte, yanlış tanımlanabilmektedirler. Bu çalışmada, çeşitli klinik örneklerden izole edilmiş ve biyokimyasal temelli sistemlerle C. glabrata olarak tanımlanmış toplam 40 suş ITS bölgesinin dizi analizi ile tür düzeyinde tanımlanmış ve antifungallere duyarlılıkları Sensititre YeastOne duyarlılık paneli ile araştırılmıştır. Suşların tamamının (%100) C. glabrata sensu stricto olduğu belirlenmiş, C. nivariensis ve C. bracarensis'e rastlanmamıştır. Belirlenen minimum inhibitör konsantrasyonu (MİK) değerleri Clinical and Laboratory Standards Institute'ün (CLSI) türe özgü klinik sınır değerlerine, bu değerlerin belirlenmemiş olduğu antifungaller için ise epidemiyolojik eşik değerlerine göre değerlendirilmiştir. Suşların tamamının (%100) flukonazole doza bağlı duyarlı; kaspofungin, anidulafungin ve mikafungine 39'unun (%97,5) duyarlı, birinin (%2,5) dirençli olduğu belirlenmiştir. Amfoterisin B ve itrakonazol için 40 (%100), posakonazol için 37 (% 92,5), vorikonazol için ise 36 (% 90) suşun vahşi tip (wild type-WT) olduğu tespit edilmiştir. C. nivariensis ve C. bracarensis'in epidemiyolojisi, virülans özellikleri ve direnç profilleri ile ilgili daha fazla araştırma yapılmasının gerektiği, ayrıca rutin mikrobiyoloji laboratuvarlarında C. glabrata kompleksinin tür düzeyinde doğru olarak tanımlanması ve antifungallere duyarlılıklarının belirlenmesinin önem taşıdığı düşünülmektedir.