Marmara Denizi'nde yaşayan bazı balık türlerinin atıklarından antimikrobiyal etkili peptitlerin tespiti ve etkinliklerinin incelenmesi


DÖŞLER S. (Yürütücü), YEMİŞKEN E., GÖK A., YILMAZ F. N.

TÜSEB A Grubu Acil AR-GE Projesi, 2023 - 2024

  • Proje Türü: TÜSEB A Grubu Acil AR-GE Projesi
  • Başlama Tarihi: Mart 2023
  • Bitiş Tarihi: Mart 2024

Proje Özeti

Günümüzde, kliniklerde kullanılan antibiyotiklere karşı bakterilerin yüksek oranda direnç geliştirmesi, araştırmacıları yeni

antimikrobik etkili kaynakların arayışına yöneltmektedir. Bunların arasında öne çıkan grupların başında, canlıların çevrelerini kuşatan

mikroorganizmalara karşı savunmalarında doğal bağışıklığın önemli unsurlarından olan antimikrobik etkili peptitler (AMP)

gelmektedir. AMP’ler; mikroorganizmalar, böcekler, amfibiyanlar, sürüngenler, balıklar, kuşlar, bitkiler, memeli hayvanlar ve insanlar

gibi karada ve suda yaşayan her tür canlıdan elde edilebilirler. Son yıllarda, bu kaynaklar arasında pozitif ayrışarak öne çıkan ve

keşfedilmeyi bekleyen çok sayıda AMP barındıran kaynaklardan biri de denizlerdir.

Deniz ekosisteminde bulunan organizmaların geliştirdikleri doğal savunma mekanizmaları, patojen mikroorganizmalara karşı

savaşımızda yeni yaklaşımların ortaya koyulmasını desteklemektedir. Belirtilen mekanizmaların anlaşılabilmesi için bu canlıların

floralarında bulunan fırsatçı patojen ve/veya patojen olmayan mikroorganizmaların tespiti ve florayı oluşturan bu organizmaların

canlının savunma mekanizmalarına katkı sağlayıp sağlamadığının belirlenmesi kritik önem arz etmektedir. Bu sayede, küresel olarak

önemli bir tehdit unsuru olan ve gitgide artan antimikrobiyal direnç nedeniyle AMP’ler gibi yeni ve doğal antimikrobiyallerin keşfine

ve eldesine katkı sağlanacaktır.

Denizel canlıların yüzeylerinde sıklıkla karşılaşılabilen bakteri kolonizasyonuna karşı koyan, ilk ve en önemli savunma mekanizması

vücudu kaplayan mukus tabakasıdır. Özellikle Elasmobranchii türlerinin epidermal hücreleri tarafından salgılanan mukus maddesi,

türlerin dış dünya ile arasındaki sınırı oluşturmaktadır. Marmara Denizi gibi kirliliklerin fazla olduğu denizlerde yaşayan canlıların

vücudunda bulunan mukus tabakasında, bu kirlilikteki çok sayıda mikroorganizma varlığında dahi hayatlarını sürdürebilmelerini

sağlayan çeşitli AMP’ler bulunmaktadır.

Bu çalışmada, öncelikle Marmara denizinden elde edilecek çeşitli balık türlerinin vücut yüzeylerinde bulunan bakteri florasının tespit

edilmesi ve izole edilen bakterilerin, farklı mikroorganizmalar üzerine antimikrobiyal aktivitesinin olup olmadığının tespit edilmesi

planlanmaktadır. Çalışmamız, Türkiye denizleri için Elasmobranchii türleri ile simbiyotik olarak yaşam süren mikroorganizmaların

tespitine yönelik yapılacak ilk çalışma özelliğini de taşımaktadır. Çalışmanın ikinci aşamasında ise Marmara Denizi’nde bol miktarda

bulunabilen bu deniz canlılarının mukus tabakasında bulunması muhtemel AMP’leri izole etmek, saflaştırmak ve antimikrobiyal

etkinliklerini belirlemeki hedeflenmektedir.