Çok duvarlı karbon nanotüplerden bakteriye özgü biyosensör geliştirilmesi


Creative Commons License

BEKTAŞ M. (Yürütücü), ÜSTÜNSOY R., ERTAŞ T., DİNÇ B., CEYLAN A. N.

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2021 - 2022

  • Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
  • Başlama Tarihi: Nisan 2021
  • Bitiş Tarihi: Kasım 2022

Proje Özeti

Patojenik bakterilerin tespiti, klinik teşhis, gıda endüstrisi, su kalitesi ve sağlık sorunları açısından oldukça önemlidir. Bakterilerin tanı ve tespiti için kullanılan yöntemler, kültür koloni sayımı, polimeraz zincir reaksiyonu ve immünoloji testlerine dayanmaktadır. Gıda ve çevresel bağlamda, bakterilerin sebep olduğu sorunlarla yüzleşmek için, hızlı ve hassas cihazların geliştirilmesi oldukça önemlidir. Üstün fizikokimyasal özelliklere sahip karbon nanotüplerin, hızlı ve hassas biyosensörlerin geliştirilmesinde oldukça etkili olduğu bilinmektedir. Son zamanlarda artan ihtiyaçlara göre, farklı özellikler kazandırılmış nanotüpler, bakteri ve virüs gibi patojenlerin tespitinde kullanılmaya başlamışlardır. Çelikten daha dayanıklı, yüzey alanı geniş bağlanma alanları barındıran, iletkenliği yüksek çok duvarlı KNT’ler, bakteriyel biyosensör geliştirme çalışmalarında öne çıkmaktadır. Çok duvarlı KNT’lerin elektron iletkenlikleri yüksektir ve yüzey alanları tek duvarlı KNT’lerden daha geniştir. Kullandığımız çok duvarlı KNT’ler, 0.5-2 µm uzunluğunda, dış yarıçapı en fazla 8 nm’yi bulan boyutlara sahip nano tüplerdir. Bu nanotüpler güçlü asit karışımları ile reflüks işlemine tabii tutularak, yüzeylerinde karboksil grupları oluşturulmuş ve sonrasında ilaç ve protein bağlanmıştır. Hücrelerde ve kıl kurdunda toksisite araştırmaları yapıldıktan sonra, ilaç taşıma etkinliği farklı hücre hatlarında değerlendirilmiştir. KNT’lerin TEM ve SEM görüntüleri alınmış, FTIR ve Raman spektroskopisi, Termogravimetrik analiz, Diferansiyel taramalı kalorimetre ile ayrıntılı karakterizasyonu gerçekleştirilmiştir. Bu KNT’ler biyosensör tasarımında kullanılacaktır. 60 µm yarıçaplı tungsten tel ve ÇDNT’ler N-dimethylformamide ortamında sonikasyona tabi tutulacak, hem tellerin sterilizasyonu sağlanacak hem de KNT’lerin dispersiyonu sağlanacaktır. Yüzeyine fonksiyonel ÇDNT’ler tutturulacak ve kablolarda KNT’ler ile yüzey modifikasyonu gerçekleştirilecektir ve 150 °C’de kurumaya bırakılacaktır. Yüzeyine KNT tutunmuş kablolara streptavidin ile muamele edilerek, yüzeydeki nanotüplere streptavidin bağlanması sağlanacaktır. Ayrıca, benzer şekilde yüzey modifikasyonu yapılmış, kablolara biyotinlenmiş anti E.coli antikorları ile muamele edilecek ve fonksiyon jeneratörü ve piko ampermetre kullanılarak ölçümler alınacaktır. E. Coli’nin K12 suşu ile deneyler gerçekleştirilecektir. Mikro kablolardan TEM görüntüleri alınacak ve hassaslıkları değerlendirilecektir. Hassasiyetleri, bakteri ekleme öncesi ve sonrasında, akım ölçümleri yapılarak gerçekleştirilecektir. Ayrıca E.coli konsantrasyonu arttırılarak deneyler tekrar edilecektir. Böylece patojen tespiti için, yüksek iletkenliğe sahip ve yüzeyine protein ve moleküllerin tutunabildiği KNT’lerin tungsten tellere entegre edilmesi ile, patojen tespitinde, öncesinde numunelerden bakteri amplifikasyonuna gerek bırakmayan, verimli bir biyosensör sistemi ortaya çıkarılacaktır