SARS-CoV-2’nin Temel Virolojik Özellikleri ve Koronavirüs Reseptör Tanıma Mekanizması


Creative Commons License

Çakal B.

Literatür Eczacılık Bilimleri Dergisi, cilt.10, ss.38-50, 2021 (Hakemli Dergi)

Özet

ÖZET Şiddetli akut solunum sendromu-koronavirüs-2 [severe acute

respiratory syndrome-coronavirus-2 (SARS-CoV-2)]’nin etiyolojik etkeni

olduğu koronavirüs hastalığı-2019 [coronavirus disease-2019

(COVID-19)] pandemisi, mevcut ve olası sonuçları açısından tüm dünyayı

etkisi altına almıştır. SARS-CoV-2, insanlarda enfeksiyona neden

olan 7.; 21. yüzyılda salgınlara neden olan 3. CoV’dur. CoV’ların konak

hücreye girişi, CoV spike proteinlerinin reseptör tanıma ve membran

füzyon fonksiyonları aracılığıyla gerçekleşir. SARS-CoV-2, insan anjiyotensin

dönüştürücü enzim 2 [human angiotensin-converting enzyme

2 (hACE2)]’yi hücre girişi için fonksiyonel bir reseptör olarak kullanır.

SARS-CoV’ların spike proteinleri, reseptör bağlayan (S1) ve membran

füzyonu (S2) ile ilişkili 2 temel alt birim içerir. SARS-CoV-2 reseptör

bağlama domaininin (RBD), ACE2’ye bağlanma afinitesinin SARSCoV’dan

daha yüksek olmasına ek olarak, viral spike proteinini kodlayan

genomda polibazik (furin) bir kesim alanı insersiyonu içermesiyle

de farklılık gösterir. Furin aracılı viral spike proteinin proteolitik aktivasyonu,

SARS-CoV-2’nin hedef hücreye giriş etkinliğini artırır.

SARS-CoV-2 spike protein RBD’nin yapısal olarak yatık konformasyonda

olması, insan immün sisteminin denetiminden kaçmasına olanak

tanımaktadır. Dolayısıyla SARS-CoV-2’nin yayılımının oldukça

geniş olması, SARS-CoV-2 RBD’nin, hACE2’ye bağlanma afinitesinin

yüksekliği, insan immün sisteminin denetiminden kaçabilme ve yüksek

enfektivite gibi özgün virolojik karakteristik özelliklere sahip olması

ile ilişkilidir. SARS-CoV-2 ve reseptörü ACE2 arasındaki

etkileşimin moleküler dinamiklerinin aydınlatılması, salgının seyri ve

sonuçları ile tedavi ve immünizasyon hedeflerinin belirlenmesinde kritik

öneme sahiptir. Bu derlemede, viral enfektivite, patogenez ve konak

aralığının belirlenmesi, aşılama, antiviral stratejiler, terapötik antikorlar

ve tanı için temel hedef olan CoV spike proteinleri ve reseptörü

hACE2’yi tanımasına yönelik mekanizmaların irdelenmesi amaçlanmıştır.

ABS TRACT The coronavirus disease-2019 (COVID-19) pandemic

which is the etiological agent of severe acute respiratory syndromecoronavirus-

2 (SARS-CoV-2) has influenced the whole world with

the current and possible results. SARS-CoV-2 is the 7th CoV known

to infect humans and also the 3rd CoV cause of outbreak in 21st century.

Receptor recognition and membrane fusion functions of CoV

spike protein mediates CoV entry into host cells. SARS-CoV-2 uses

to human angiotensin-converting enzyme 2 (hACE2) as a functional

receptor for cell entry. The spike proteins of SARS-CoVs contain two

basic subunits associated with receptor binding (S1) and membrane

fusion (S2). Unlike SARS-CoV, SARS-CoV-2 contains a polybasic

(furin) cleavage site insertion in genome encoding viral spike protein

and the receptor binding domain (RBD) of SARS-CoV-2 has higher

ACE2 binding affinity to ACE2. Proteolytic activation of spike protein

by furin increases efficiency of entry into target cell of SARSCoV-

2. And also a lying-down position of RBD of the SARS-CoV-2

spike protein allows to evade from surveillance of human immune

system. The wide spread of SARS-CoV-2 is associated with the

unique virological characteristics of SARS-CoV-2, such as the ability

to high binding affinity to hACE2, escape from the human immune

surveillance system and high infectivity. Identification of molecular

dynamics of the interaction between SARS-CoV-2 and receptor

ACE2 is critical in determining the course and outcomes of the outbreak

and the targets of treatment and immunization. In this review,

it is aimed to examination of mechanisms recognition for hACE2 receptor

of its with spike proteins of CoV which is the main target for

vaccination and antiviral strategies, therapeutic antibodies and diagnostics

with determination viral infectivity, pathogenesis and host

range.