Akademik Veri Yönetim Sistemi
Sunum, ss.82, 2023
RNA moleküllerinin yapıları, işlevleri ve kararlılıkları hücreler tarafından modifikasyon adı verilen özel kimyasal düzenlemeler aracılığıyla düzenlenir. Bugüne kadar tRNA, rRNA, mRNA ve miRNA gibi farklı RNA türleri üzerinde 150’ye yakın farklı nükleozit modifikasyonu tespit edilmiştir. Son yıllarda yapılan çalışmalar bu modifikasyonların RNA türleri üzerindeki dağılımının, transkripsiyon ve translasyon dahil olmak üzere birçok hücre içi moleküler mekanizma üzerinden protein üretimini etkileme yani değiştirme kapasitesine sahip olduğunu göstermektedir. Örneğin, RNA modifiye edici enzimler arasında tRNA metil-transferaz (trm) nükleozit modifiye edici enzim ailesi önemli bir yere sahiptir çünkü tRNA metilasyonlarının tRNA yapısının stabilizasyonundan, kodon-antikodon etkileşiminin güçlendirilmesi ve Wobble baz eşleşmesinin düzenlenmesine kadar protein sentezinin birçok farklı adımı ile bağlantılı olduğu tespit edilmiştir. Biz bu çalışmada, Saccharomyces cerevisiae RNA metil-transferaz nükleozit modifiye edici enzim mutantlarının (trm1Δ, trm2Δ, trm4Δ, trm10Δ ve trm11Δ) farklı tuz stresi koşullarına (NaCl, KCl ve MgCl2) verdiği tepkiyi anlamaya çalışıyoruz. Bu hücresel ve çevresel koşulların yarattığı tuz stresinin yabanıl ve mutant maya hücrelerinin büyüme profillerine ve eğrilerine nasıl etki ettiğini ortaya koyuyoruz. Böylece belirtilen stres koşullarına duyarlı ya da dirençli trm gen mutantlarını tespit ederek ilerde yapacağımız moleküler çalışmaları için (gen-fonksiyon, vb.) gerekli öncü verileri elde etmiş olacağız.