İnsan Akciğer Karsinomu Hücre Hattında Lncrna PVT1 ve Mir-128'in İfade Düzeylerinin Belirlenmesi


Tunoglu E. N. Y., NUR Ö. G., AKAR O., Ulukaya E., Küçük S. T., karpuzoglu h.

Sabiad , cilt.8, sa.2, ss.69-75, 2025 (Hakemli Dergi) identifier

  • Yayın Türü: Makale / Tam Makale
  • Cilt numarası: 8 Sayı: 2
  • Basım Tarihi: 2025
  • Doi Numarası: 10.26650/jarhs2025-1608689
  • Dergi Adı: Sabiad
  • Derginin Tarandığı İndeksler: TR DİZİN (ULAKBİM)
  • Sayfa Sayıları: ss.69-75
  • İstanbul Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Amaç: Araştırmamızın amacı, normal akciğer epitel hücre hatlarında (BEAS-2B) ve insan akciğer karsinomunda (A549), mikroRNA-128 (miR-128) ve uzun kodlamayan RNA (lncRNA) PVT1 ekspresyonunu inceleyerek, bu moleküllerin akciğer kanserinin gelişimi ve ilerlemesinde oynayabileceği potansiyel rolleri belir- lemektir. Gereç ve Yöntemler: Bu araştırmada kullanılan hücre hatları A549 ve BEAS-2B'dir. Gerçek zamanlı kantitatif PCR (RT-qPCR) yöntemi kullanılarak PVT1 ve miR-128'in ifade seviyeleri değerlendirildi. 2- ∆∆Ct yöntemi, U6 snRNA ve GAPDH ifadelerine göre normalize ederek kat değişimlerini incelemek için kullanıldı. Bulgular: Akciğer kanseri hücrelerinde PVT1 ekspresyonunun yük- seldiği belirlendi (p<0,01). Bununla birlikte, miR-128 ekspresyonu istatistiksel olarak anlamlı bir şekilde değişmedi (p>0,05). Mir-128, in-silico analizde lncRNA PVT1'in potansiyel bir bağlanma hedefi olmasına rağmen, ekspresyon profili sonuçlarına göre korelasyon görülmedi. Sonuç: Normal akciğer epitel hücrelerine kıyasla akciğer kanseri hücrelerinde lncRNA PVT1 ve miR-128 arasındaki ilişkinin in- celendiği çalışmamız, PVT1 ekspresyonunun akciğer kanseri hücrelerinde önemli ölçüde yüksek olduğunu, buna karşın miR-128 ekspresyonunun değişmeden kaldığını ortaya koymak- tadır. LncRNA PVT1 ve miR-128 arasındaki etkileşimin dolaylı olup olmadığını keşfetmek için daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır.
Objective: In the presented research, we aimed to examine the expression of microRNA-128 (miR-128) and long non-coding RNA (lncRNA) the plasmacytoma variant translocation 1 (PVT1) in non- cancerous cells BEAS-2B and human lung carcinoma A549 to identify any potential roles these molecules might play in the cancer development in lung tissue. Material and Methods: The cell lines used in this research were A549 and BEAS-2B. Total RNA was isolated from these cell lines, and then complementary DNA (cDNA) was synthesised. Using the quantitative real-time PCR (RT-qPCR) method, the expression lev- els of lncRNA PVT1 and miR-128 were evaluated. The 2-∆∆Ct method was employed to analyse fold changes by normalising to U6 snRNA and GAPDH expressions. Results: Elevated PVT1 expression was determined in the lung cancer cells (p<0.01). Nevertheless, miR-128 expression did not change statistically significantly (p>0.05). Even though miR-128 is a potential binding target of lncRNA PVT1 according to in silico analysis, the expression profile does not correlate. Conclusion: Our evaluation of the relationship between lncRNA PVT1 and miR-128 in cancerous cells A549 compared with non-can- cerous cells BEAS-2B reveals that PVT1 expression is significantly elevated in lung cancer cells, whereas miR-128 expression remains unchanged. Further investigation is needed to explore whether the interaction between lncRNA PVT1 and miR-128 is indirect.