Overin selim ve malign hastalıklarında CYB5R4 geninin metilasyon değişikliklerinin araştırılması
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: İstanbul Üniversitesi, Onkoloji Enstitüsü, Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2023
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: AYŞEGÜL GÖNÇ
Danışman: Şeref Buğra Tunçer
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Kanser genetik temelli karmaşık bir hastalıktır. Kanser oluşumuna katkıda bulunan epigenetik değişikliklerin ortaya konmasıyla birlikte, karsinogenezin daha anlaşılır hale geleceği düşünülmektedir. Kanser ile ilişkisi sıklıkla araştırılan epigenetik mekanizmalardan biri DNA metilasyonudur. Over kanseri düşük sağ kalım oranı ile tedavisi zor kanser türleri arasındadır. Tez çalışmamızda over kanserinde CYB5R4 geninin metilasyon düzeyleri geniş bir kohortta hasta, benign ve sağlıklı kontrol gruplarında incelenmiştir. İstanbul Üniversitesi Onkoloji Enstitüsü'ne başvuran 98 over kanserli hasta, 49 overin benign hastalıklarına sahip kişi ve 57 sağlıklı kontrol grubundan oluşan toplam 204 kişi ile tez çalışması tamamlanmıştır. Çalışmaya katılan tüm katılımcılardan alınan kan örneklerine hücre ayrıştırma işlemi uygulanmış ve elde edilen hücrelerden DNA izolasyonu gerçekleştirilmiştir. Real-Time cihazında, kantitatif PCR işlemleri yapılarak hasta ve diğer kontol grupları arasında DNA örneklerinin metilasyon durumu karşılaştırılmıştır. Kantitatif analiz sonucu CYB5R4 geninin metilasyon düzeyinin %6'nın altında olması durumunda gen unmetile, %6'nın üstü olması durumunda ise gen metile olarak kabul edilmiştir. Over kanser hasta grubunun %69,39'unun CYB5R4 geni metile, %30,61'i unmetile iken, overinde benign kitleye sahip olan kişilerde CYB5R4 geni, %30,61'i metile %69,39'unun unmetile ve sağlıklı kontrol grubunda ise CYB5R4 geni %29,82'sinde metile %70,18'inde unmetile bulunmuştur. CYB5R4 geninin metilasyon düzeyi, BRCA1 gen mutasyon durumu, etnik köken, menopoz durumu, tedavi öncesi ve sonrası CA125 düzeyi ve yaş ile istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur. Bu sebeple CYB5R4 gen metilasyonunun over kanserinde potansiyel bir biyomarker adayı olabileceği düşünülmektedir. Genin biyomarker niteliğinin genel popülasyonda araştırılması gerekliliği anlaşılmıştır. Gelecekte yapılacak çalışmalar ile genin ekspresyon düzeyinin ve kodladığı proteinin hücre yolaklarındaki etkisinin araştırılması hedeflenmektedir.