Oral skuamöz hücreli karsinomda GABRB2 geninin metilasyon ve ekspresyon seviyelerinin incelenmesi


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: İstanbul Üniversitesi, Onkoloji Enstitüsü, Teşhis Tedavi Ve Bakım Hizmetleri, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2017

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Sena ŞEN

Danışman: Semra Demokan

Özet:

Oral skuamöz hücreli karsinom (OSCC), dünyada yıllık gözlenen baş-boyun kanser (HNC) vakalarının %50’sini, oral kanserlerin ise %90’dan fazlasını oluşturmaktadır. OSCC‘nin teşhis edildiği aşamada hastalığın ileri evrede olması yüksek morbidite ve mortaliteye neden olmaktadır. OSCC’li hastaların sadece %51 inin, 5 yıldan fazla sağ kalabildiği tespit edilmiştir ve son yıllarda yapılan çalışmalarda yaşam süresinin uzamasına anlamlı katkı sağlayacak bir ilerleme gerçekleşmemiştir. Sigara ve alkol kullanımı, etnik köken, yaş ve coğrafik bölge gibi etiyolojik faktörler OSCC kanserinin gelişiminde rol oynamaktadır. Kanserde genetik değişiklikler kadar epigenetik değişiklikler de söz konusudur. Birçok kanser türünde tümör supressör genlerin promoter bölgelerindeki CpG adalarının metillenmesiyle bu genlerin görevini yerine getiremediği gösterilmiştir. Prof. Dr. Semra Demokan ve arkadaşlarının yaptığı TÜBİTAK-SBAG-114S497 no’lu çalışmamızda OSCC hastalarının tümör dokuları ile eşlenik normal dokularındaki ekspresyon ve metilasyon array verilerine göre GABRB2 geninin CpG adacıklarının metillenmiş olduğu ve buna bağlı olarak ekspresyon seviyelerinde azalma olduğu gözlemlenmiştir. Gamma-Aminobutyric Acid Receptor, Beta-2 (GABRB2) geni 5. kromozomun q kolunun 34. bandına lokalize olup Gama-aminobütirik asit (GABA) reseptörünü kodlamaktadır. GABA, ligand kapılı klorür kanalları olan GABA-A reseptörleri ile ilişkili beyindeki ana inhibitör nörotransmitterdir. Literatürde GABRB2 geninin OSCC hastalarında yapılan herhangi bir metilasyona bağlı ekspresyon değişimi ile ilgili çalışmaya rastlanılmamıştır. Çalışmamızda, OSCC hastalarının eşlenik normal ve tümör doku materyallerinde GABRB2 geninin metilasyon ve ekspresyon durumları incelenerek ileri validasyon çalışmaları yapılacaktır. Buna ek olarak OSCC hastalarından alınan serum materyallerinde metilasyon varlığı incelenerek GABRB2 geninin invaziv/non-invaziv yöntemlerle tanı, teşhis ve tedavide potansiyel biyomarker olarak kullanılabilirliği araştırılması amaçlanmıştır.