Larenks Kanserli Hastalarda GNG7 Geninin Ekspresyon ve Metilasyon Seviyelerinin İncelenmesi

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: İstanbul Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Onkoloji Enstitüsü Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2016

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: CANSU ÖZKÖKLEŞEN

Danışman: Semra Demokan

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Kodlanan DNA dizisinde değişikliğe neden olmadan gen ekspresyonunu düzenleyen anormal DNA hipermetilasyonu kanserin temel özellikleri arasında yer almaktadır. 2013 yılında Demokan ve arkadaşları tarafından yapılmış olan çalışmada, baş-boyun kanserli hastaların %61'inde tümör dokularında oldukça fazla metilasyonu görülmesine karşın, normal mukoza ve tükürük örneklerinde hiç metilasyonu görülmeyen guanin nükleotid bağlayıcı protein γ-7 (GNG7) geninin hastalığın erken tanısı için potansiyel bir biyobelirteç olabileceği belirtilmiştir. Bu pilot çalışmanın devamı niteliğinde tasarlanmış olan projemizde, 50 larenks kanseri tanısı almış hastaya ait tümör, normal doku, serum ve tükrük örnekleri ile ailesinde ve kendisinde malin/benin tümör hikayesi bulunmayan 20 sağlıklı kişiye ait normal doku, serum ve tükürük örneklerinde GNG7 geninin mRNA ekspresyon seviyeleri QRT-PCR ve relatif metilasyonu oranı QMSP yöntemleri ile belirlenmiş ve klinik/patolojik verilerle karşılaştırılmıştır. Literatürde GNG7 geninin ekspresyon ve metilasyon seviyelerini tümör ve eşlenik normal doku ile vücut sıvılarında inceleyen bir çalışma yoktur. Hastaların %76'sında eşlenik normal dokuya, %78'inde kontrol grubuna ait sağlıklı dokuya oranla GNG7 geninin mRNA ekspresyonu azalmıştır. Hastalara ait eşlenik normal, serum ve tükürük örnekleri ile sağlıklılara ait örneklerde hiç metilasyonu gözlenmezken, 11 hastanın tümör dokusunda %0,1 ile %32,7 arasında değişen relatif metilasyonu oranı saptanmıştır. Hastaların %20'sinde ise, GNG7 geninin promoter hipermetilasyonuna bağlı sessizleşme görülmüştür. Metilasyon ilişkili sessizleşme ileri evre ile orta ve az farklılaşma karakteri ile ilişkilidir.