Met-Tyr dipeptidinin konformasyon analizi ve kuantum kimyasal yöntemleri ile titreşim frekans ve kiplerinin incelenmesi

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Fizik Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2016

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: DEMET ÇETİN

Danışman: Ayşen Özel

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu tez çalışmasında Metionin ve Tirozin amino asitlerinden oluşan Met-Tyr dipeptidinin yapısal ve titreşimsel özellikleri teorik ve deneysel moleküler spektroskopik yöntemler ile incelenmiştir. Çalışmanın teorik kısmında, bir potansiyel enerji yüzey taraması ile, Met-Tyr dipeptidinin teorik olarak mümkün olan kararlı konformasyonları araştırılmış ve belirlenen en kararlı konformere ait optimize edilmiş denge durumu geometrik parametreleri hesaplanmıştır. Ardından, bu en kararlı konformerin titreşim modlarına ait dalgasayıları, Kırmızıaltı (IR) ve Raman şiddetleri hesaplanmıştır. Gaussian03 paket programı kullanılarak gerçekleştiren bu hesaplamalarda Yoğunluk Fonksiyonu Teorisi (DFT)'ne dayalı B3LYP metodu kullanılmıştır. Çalışmanın deneysel kısmında Met-Tyr dipeptidinin Kırmızıaltı ve Raman spektrumları, Jasco300 FT-IR and Micro Raman NRS3100 model dispersif mikro Raman spektrometreler kullanılarak, oda sıcaklığında kaydedilmiştir. Çalışmanın son bölümünde ise molekülün hesaplanan titreşimsel spektral verileri onun kaydedilen deneysel IR ve Raman spektrumlarından elde edilenler ile karşılaştırıldı ve ardından gözlenen temel titreşimsel bandların işaretlemeleri molekülün titreşimsel modları için hesaplanan Potansiyel Enerji Dağılımı (PED) değerleri baz alınarak gerçekleştirilmiştir.