BİR MAĞARADAN İZOLE EDİLEN BAKTERİLERİN ANTİMİKROBİYAL MADDE ÜRETME YETENEĞİ VE ANTİBİYOTİK DİRENÇLİLİĞİ
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2018
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: BEGÜM ÇANDIROĞLU
Danışman: Nihal Doğruöz Güngör
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Dünya'nın farklı koşul ve ortamlarında yaşayabilen birbirinden farklı çok sayıda mikroorganizma olduğu bilinmektedir. Mağaralar, yüksek nem oranı, karanlık ve genelde stabil düşük sıcaklığa sahip ekstrem ortamlardır. Bu yer altı boşluklarının özellikle az miktarda besine ve oksijene sahip olması, burada hayatta kalmayı başarabilen mikroorganizmaların ender ve/veya farklı özelliklere sahip olabileceğini akla getirmektedir. Bu çalışma kapsamında Parsık Mağarası' na (İzmit, Türkiye) ait kültüre edilebilen aerobik heterotrofik bakteri çeşitliliğinin ortaya çıkarılması, izole edilen bu bakterilerin antimikrobiyal madde üretme potansiyelleri ve antibiyotik dirençlilik profillerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Mağara yüzey oluşumlarından, sudan ve topraktan alınan örneklerden bakteri izolasyonu gerçekleştirilmiştir. Mağara örneklerine ait kültüre edilebilen aerobik heterotrofik bakteri sayısı R2A ve TWA besiyerleri kullanılarak koloni sayma yöntemi ile, total ölü/canlı bakteri sayısı ise DAPI/CTC floresan boyama yöntemi ile ortaya çıkarılmıştır. İzole edilen bakterilerin adlandırılması ve enzimatik özelliklerinin belirlenmesi Vitek 2 Compact 30 mikroidentifikasyon sistemi ile gerçekleştirilmiştir. Yapılan analiz sonuçlarına göre, Parsık Mağarası' ndan alınan tüm örneklerden Proteobacteria, Firmicutes ve Actinobacteria filumlarına ait bakteriler izole edilmiştir. Yüzey oluşumlarından ve sudan alınan örneklerde Kocuria, toprak örneklerinde ise Lysinibacillus en sık rastlanan bakteri cinsi olararak belirlenmiştir. Enzimatik reaksiyonları içeren veriler, Parsık Mağarası' ndan izole edilen bakterilerin genellikle proteolitik aktiviteye sahip olduğunu göstermiştir. Bu durum incelenen bakterilerin endüstriyel kullanım potansiyelini ortaya koymaktadır. Bakterilerin direnç profili incelendiğinde, ampisiline dirençlilik frekansı yüksek bulunmuşur. Tez deneyleri kapsamında izole edilen Bacilli ve Actinomycetes sınıfına ait seçili bakterilerin, Escherichia coli (ATCC 8739), Pseudomonas aeruginosa (ATCC 9027), Staphylococcus aureus (ATCC 6538), Bacillus subtilis (ATCC 6633), Staphylococcus epidermidis (ATCC 12228), Klebsiella pneumoniae (ATCC 4352), Enterococcus fecalis (ATCC 10541), Candida albicans (ATCC 10231), metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) (ATCC 33591) ile vankomisine dirençli Enterococcus fecalis (VRE) (ATCC 51299) patojen suşlarına karşı antimikrobiyal aktiviteleri değerlendirilmiş, en fazla (% 3,87) Candida albicans üzerinde etkili suş tespit edilmiştir. Elde edilen bulgular Parsık Mağara izolatlarının metabolik aktiviteleri, substratlara verdikleri reaksiyonlar, antibiyotik dirençlilik frekansları ve antimikrobiyal aktivitelerine yönelik ilk verileri sağlamıştır.