Biyografi
Lisans eğitimini İstanbul Üniversitesi Biyoloji Bölümü'nde tamamlayarak yüksek onur derecesi ile mezun olmuştur. Eğitim hayatının başından itibaren çeşitli bilimsel proje ve faaliyetlerde, gönüllü ve resmi olarak yer almıştır. Biyoloji Bölümü bünyesinde faaliyet gösteren Biyolojik Bilimler Kulübü'nün ilk divan kurulu üyelerinden olup Medya ve İletişim Koordinatörlüğü'nün kurucu başkanlığını yapmıştır. Yüksek lisans eğitimini Zooloji Anabilim Dalı'nda tamamlamış ve taban omurgasızları üzerine yaptığı teziyle Zooloji alanında uzmanlığını kazanmıştır. Uzmanlığını aldıktan sonra çalışma yöntemleri ve hedefleri yeni bir bakış açısı kazanmış ve Biyoteknoloji Anabilim Dalı'nda hala sürdürmekte olduğu doktora eğitimine ve Biyoinformatik alanındaki doktora tezine başlamıştır. Biyoloji Bölümü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı'nda Araştırma Görevlisi olarak çalışmaya başladığından beri, mevcut bilgi birikimini biyoloji bilimi ve insan faydası için uygulamak amacıyla çeşitli ulusal ve uluslararası fikir ve projelerde yer almaktadır. Alan içi gelişimine devam etmekte olup, Biyoteknoloji ve Biyoinformatik alanında araştırmalarını sürdürmektedir.
Eğitim Bilgileri
2023 - Devam Ediyor
2023 - Devam EdiyorDoktora
İstanbul Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Fen Fakültesi Bölümü, Türkiye
2019 - 2022
2019 - 2022Yüksek Lisans
İstanbul Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Fen Fakültesi Bölümü, Türkiye
2014 - 2019
2014 - 2019Lisans
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Türkiye
Yaptığı Tezler
2022
2022Yüksek Lisans
Akarsu Makrobentik Omurgasızlarının Kuraklığa Karşı Dayanıklılığının Araştırılması
İstanbul Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Fen Fakültesi Bölümü
Yabancı Diller
A2 Temel
A2 TemelJaponca
A1 Başlangıç
A1 Başlangıçİspanyolca
C2 Ustalık
C2 Ustalıkİngilizce
Sertifika, Kurs ve Eğitimler
2018
2018Diksiyon, Hitabet ve Etkili Konuşma
Kişisel Gelişim
Dialog Anlatım İletişim
Araştırma Alanları
Biyoinformatik
Biyoteknoloji
Çevre Biyolojisi
Hayvan Biyolojisi
Akademik Faaliyetlere Dayalı Araştırma Alanları
Avesis Araştırma Alanları
WoS Araştırma Alanları
Scopus Araştırma Alanları
Akademik Ünvanlar / Görevler
2021 - Devam Ediyor
2021 - Devam EdiyorAraştırma Görevlisi
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü
Akademi Dışı Deneyim
2018 - 2021
2018 - 2021Eğitmen
Şirket, Usturlab Eğitim Danışmanlık Ve Organizasyon Limited Şirketi, Orman Kaşifleri Eğitimi, Eğitmen
Verdiği Dersler
Lisans
Bakteri Genetiği (Lab)
Karşılaştırmalı Omurgalı Anatomisi (Lab)
Biyoteknolojide Mikrobiyoloji Uygulamaları (Lab)
Bees and Pollination (Lab)
Genetics (Lab)
Omurgasız Hayvanlar (Lab)
Biyoteknolojide Biyosidal Ürünler (Lab)
Omurgalı Hayvanlar (Lab)
Histoloji (Lab)
Deniz Balıkları Sistematiği (Lab)
Hayvan Biyolojisi (Lab)
Hidrobiyoloji (Lab)
Makaleler
2026
20261. MetaPepticon: automated prediction of anticancer peptides from microbial genomes and metagenomes.
Erözden A. A., Tavşanli N., Demirel G., Şanli N. Ö., Çalişkan M., Arikan M.
PeerJ
, cilt.14, 2026 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20242. Evaluation of small-molecule modulators of the circadian clock: promising therapeutic approach to cancer
TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A., ÇALIŞKAN M.
MOLECULAR BIOLOGY REPORTS
, sa.1, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20243. Advances in bioinformatic approaches to tardigrade phylogeny
ERÖZDEN A. A., TAVŞANLI N., ÇALIŞKAN M.
COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY
, cilt.113, 2024 (SCI-Expanded)
2023
20234. A Morphometric Study of Hemidactylus turcicus Populations on the Istanbul Islands of Türkiye with Predictions of Potential Distributions
Kaya N., ÖZULUĞ O., Yıldız M. Z., İNCİ H., ERÖZDEN A. A., Çetin D., et al.
Herpetological Conservation and Biology
, cilt.18, sa.3, ss.477-487, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
20225. Museum pests in mammal furs: An investigation of the correlation between pests and host furs
ÖZULUĞ O., UÇAR F. B., ERÖZDEN A. A., KAYA N.
JOURNAL OF THE ENTOMOLOGICAL RESEARCH SOCIETY
, cilt.24, sa.3, ss.417-427, 2022 (SCI-Expanded)
2022
20226. Anthocyanin Addition to Kefir: Metagenomic Analysis of Microbial Community Structure.
Aydin S., Erözden A. A., Tavşanlı N., Müdüroğlu A., Çalışkan M., Kara İ.
Current microbiology
, cilt.79, sa.11, ss.327, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2025
20251. MetaPepticon: automated anticancer peptide prediction from genomics and metagenomics datasets
Erözden A. A., Tavşanli N., Demirel G., Şanli N. Ö., Çalişkan M., Arikan M.
EMBO | EMBL Symposium: The Human Microbiome, Heidelberg, Almanya, 16 - 19 Eylül 2025, (Yayınlanmadı)
2024
20242. MetaPepticon: An Automated Pipeline for Anticancer Peptide Prediction from Shotgun Metagenomics Datasets
Erözden A. A., Tavşanlı N., Demirel G., Şanlı N. Ö., Çalışkan M., Arıkan M.
The 17th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, İstanbul, Türkiye, 18 - 20 Aralık 2024, ss.31, (Özet Bildiri)
Kitaplar
2026
20261. Microbial Omics
Erözden A. A., Tavşanlı N., Çalışkan M., Arıkan M.
Microbial World: Bacteria and Archaea, ÇALIŞKAN MAHMUT,ARIKAN MUZAFFER, Editör, Springer, Cham, London, ss.333-366, 2026
2026
20262. Biotechnological Applications of Archaea
TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A., ARIKAN M., ÇALIŞKAN M.
Microbial World: Bacteria and Archaea, ÇALIŞKAN MAHMUT, ARIKAN MUZAFFER, Editör, Springer Nature Switzerland, İstanbul, ss.191-216, 2026
2023
20233. The Diversity of Gut Bacteria and Psychological Disorders
Aydın S., Tavşanlı N., Erözden A. A., Çalışkan M.
Genetic Diversity - Recent Advances and Applications, Prof. Dr. Mahmut Çalışkan, Editör, Intech Open, London, ss.1-20, 2023
Desteklenen Projeler
2025 - Devam Ediyor
2025 - Devam EdiyorMikrobiyom Araştırma Çalışmaları Kapsamında Biyoteknoloji Araştırma Laboratuvarı Altyapısı Sürekliliği Desteği
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ARIKAN M. (Yürütücü), ÇALIŞKAN M., TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A.
2025 - Devam Ediyor
2025 - Devam Ediyorİstanbul Boğazındaki Mikroplastik Kirliliğinin Balık Mikrobiyomlarına Etkilerinin Entegre Multi-Omik Analizlerle İncelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ARIKAN M. (Yürütücü), MÜLAYİM A., TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A., ÇALIŞKAN M., ÇAĞLAR S.
2025 - Devam Ediyor
2025 - Devam EdiyorKriptokrom1 proteini ikincil pakete bağlanan moleküllerin sirkadiyen saat üzerine olan etkilerinin hayvan modelinde incelenmesi, preklinik çalışma
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), BARIŞ İ., KAVAKLI H., OKYAR A., ARIKAN M., ERÖZDEN A. A., et al.
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorAntibakteriyel-Biyouyumlu 3B Basılı Salyangoz Müsini-Jelatin (MüJel) Bazlı Yara Örtülerinin Üretimi ve Karakterizasyonu
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), ERÖZDEN A. A., TAVŞANLI N., DEMİREL G., ARIKAN M.
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam Ediyor
Antarktik Toprak Mikrobiyotasında Kolorektal Kanser Tedavisinde Kullanılabilecek Aday Antikanser Peptitlerin Tespiti ve In Vitro Test Edilmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ARIKAN M. (Yürütücü), ÇALIŞKAN M., TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A., ŞANLI N. Ö., DEMİREL G.
2025 - 2026
2025 - 2026Asya kaplan sivrisineğinde Cry toksin etkinliği ile bağırsak mikrobiyotası arasındaki ilişkinin incelenmesi
TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı
Arikan M., Çalişkan M., Erözden A. A., Tavşanli N., Gün G.
2024 - 2026
2024 - 2026
Hedefe Yönelik Antiproliferatif Ajanların Albümin Bağlı Paklitaksel ile Birlikte Kullanımının Farklı Meme Kanseri Hücre Hatlarında Hücresel Moleküler ve Biyoinformatik Yaklaşımlarla Değerlendirilmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
Topçul M. R. (Yürütücü), Atalar F., Çetin İ., Tavşanlı N., Erözden A. A., Özgen Ö., et al.
2022 - 2024
2022 - 2024Green All Together (GreAT)
Erasmus Projesi , Erasmus+ KA2 Yenilik ve İyi Uygulamaların Değişimi için İşbirliği Projesi, Ulusal Düzey
(Proje Özeti)
Aydın S. (Yürütücü), Çalışkan M., REİSOĞLU Ş., Tavşanlı N., Erözden A. A.
2018 - 2019
2018 - 2019Biyoloji Bölümü Zooloji Koleksiyonundan Toplanmış Müze Zararlısı Böcekler Üzerine Taksonomik Bir Çalışma
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
(Proje Özeti)
Erözden A. A., Özuluğ O. (Yürütücü)
Öğrenci Projeleri
2022 - 2023
2022 - 2023Diyafonizasyon Yöntemi ile Sıçan İskeletinin Görselleştirilmesi
Diğer
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Türkiye
Etkinlik Organizasyonlarındaki Görevler
Nisan 2019
Nisan 2019Bölümümüzde Mikrobiyoloji Araştırmaları
Öğrenci Kulübü ve Toplulukları Faaliyeti
Erözden A. A.
İstanbul, Türkiye
Nisan 2019
Nisan 2019II. Sinirbilim Okulu
Öğrenci Kulübü ve Toplulukları Faaliyeti
Erözden A. A., İnci H.
İstanbul, Türkiye
Haziran 2018
Haziran 2018I. Sinirbilim Okulu
Öğrenci Kulübü ve Toplulukları Faaliyeti
Erözden A. A., İnci H.
İstanbul, Türkiye
Kongre ve Sempozyum Katılımı Faaliyetleri
18 Aralık 2024 - 20 Aralık 2024
18 Aralık 2024 - 20 Aralık 2024The 17th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics
Katılımcı
İstanbul-Türkiye
17 Temmuz 2023 - 19 Temmuz 2023
17 Temmuz 2023 - 19 Temmuz 2023Ekoloji ve Evrimsel Biyoloji Sempozyumu
Katılımcı
İstanbul-Türkiye
26 Kasım 2016 - 27 Kasım 2016
26 Kasım 2016 - 27 Kasım 2016Boğaziçi Üniversitesi Evrim Günleri
İzleyici / Dinleyici
İstanbul-Türkiye
Davetli Konuşmalar
Aralık 2025
Aralık 2025Makale Grubu: Tardigradlar
Seminer
İstanbul Üniversitesi Evrim Topluluğu-Türkiye
Kasım 2025
Kasım 2025STEM Günü Etkinliği / Genlerin Dili: Biyoinformatik
Çalıştay
TetraLearn-Türkiye
Mayıs 2023
Mayıs 2023Zooloji - Botanik Tayin Anahtarı Etkinliği
Çalıştay
İstanbul Üniversitesi Biyolojik Bilimler Kulübü-Türkiye
Ekim 2021
Ekim 2021Akademik Hayata Dair Sohbetler
Seminer
İstanbul Üniversitesi Biyolojik Bilimler Kulübü-Türkiye
Kasım 2018
Kasım 2018