Education
2022 - Present
2022 - PresentDoctorate
Istanbul University, Faculty of Science, Depertment of Biology, Turkey
2018 - 2021
2018 - 2021Postgraduate
Bursa Technical University, Instıtute Of Scıence, Department Of Bıotechnology (Interdıscıplınary), Turkey
2011 - 2016
2011 - 2016Undergraduate
Istanbul Technical University, Fen-Edebiyat, Moleküler Biyoloji Ve Genetik, Turkey
Dissertations
2021
2021Postgraduate
Inula viscosa Bitki Ekstraktının Sağlıklı ve Kanser Hücre Hatları Üzerindeki Sitotoksik ve Genotoksik Etkilerinin Araştırılması
Bursa Technical University, Instıtute Of Scıence, Department Of Bıotechnology (Interdıscıplınary)
Foreign Languages
C1 Advanced
C1 AdvancedEnglish
Certificates, Courses and Trainings
2016
2016Pedagojik Formasyon Sertifikası
Personal Evolution
Bursa Uludağ Üniversitesi
Research Areas
Life Sciences
Biotechnology
Molecular Biology and Genetics
Genetic Engineering
Academic Positions
2020 - Present
2020 - PresentResearch Assistant
Istanbul University, Faculty of Science, Depertment of Biology
Courses
Undergraduate
Undergraduate
Mikrobiyal Çeşitlilik (Lab)
Metagenomik (Lab)
Özel Mikrobiyolojik Yöntemler (Lab)
Biyokimya (Lab)
Biyoteknoloji Uygulamaları (Lab)
Genetics (Lab)
Genel Biyoloji II (Lab)
Bakteri Genetiği (Lab)
Genetik Mühendisliği (Lab)
Yaşam Bilimleri II (Lab)
Yaşam Bilimleri I (Lab)
Mikrobiyoloji (Lab)
Articles
All (5)
SCI-E, SSCI, AHCI (5)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (5)
Scopus (5)
2024
20241. Evaluation of small-molecule modulators of the circadian clock: promising therapeutic approach to cancer
TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A., ÇALIŞKAN M.
MOLECULAR BIOLOGY REPORTS
, no.1, 2024 (SCI-Expanded)
2024
20242. Advances in bioinformatic approaches to tardigrade phylogeny
ERÖZDEN A. A., TAVŞANLI N., ÇALIŞKAN M.
COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY
, vol.113, 2024 (SCI-Expanded)
2024
20243. Evaluating the potential effect of microalgae on soymilk vegan kefir in terms of physical, chemical, microbiological properties
Tavşanlı N., Yıldız S., Çalışkan M., Aydin S.
ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS
, vol.82, 2024 (SCI-Expanded)
2023
20234. Bioaugmentation of the green alga to enhance biogas production in an anaerobic hollow-fiber membrane bioreactor
AYDIN S., Fakhri H., TAVŞANLI N.
BIOFOULING
, vol.39, no.4, pp.349-358, 2023 (SCI-Expanded)
2022
20225. Anthocyanin Addition to Kefir: Metagenomic Analysis of Microbial Community Structure.
Aydin S., Erözden A. A., Tavşanlı N., Müdüroğlu A., Çalışkan M., Kara İ.
Current microbiology
, vol.79, no.11, pp.327, 2022 (SCI-Expanded)
Papers Presented at Peer-Reviewed Scientific Conferences
2025
20251. MetaPepticon: automated anticancer peptide prediction from genomics and metagenomics datasets
Erözden A. A., Tavşanli N., Demirel G., Şanli N. Ö., Çalişkan M., Arikan M.
EMBO | EMBL Symposium: The Human Microbiome, Heidelberg, Germany, 16 - 19 September 2025, (Unpublished)
2024
20242. MetaPepticon: An Automated Pipeline for Anticancer Peptide Prediction from Shotgun Metagenomics Datasets
Erözden A. A., Tavşanlı N., Demirel G., Şanlı N. Ö., Çalışkan M., Arıkan M.
The 17th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, İstanbul, Turkey, 18 - 20 December 2024, pp.31, (Summary Text)
2021
20213. Comparison of the cytotoxic effects of Inula viscosa methanol and water extracts on normal and cancer human lung cell lines
Tavşanlı N., Taner G.
1 st International Conference on Applied Engineering and Natural Sciences, Konya, Turkey, 1 - 03 November 2021, pp.602, (Summary Text)
Books
2023
20231. The Diversity of Gut Bacteria and Psychological Disorders
Aydın S., Tavşanlı N., Erözden A. A., Çalışkan M.
in: Genetic Diversity - Recent Advances and Applications, Prof. Dr. Mahmut Çalışkan, Editor, Intech Open, London, pp.1-20, 2023
2022
20222. Genetic Polymorphisms: New Insights
Çalışkan M. (Editor), Tavşanlı N. (Editor)
IntechOpen, London, 2022
Funded Projects
2025 - Present
2025 - PresentMikrobiyom Araştırma Çalışmaları Kapsamında Biyoteknoloji Araştırma Laboratuvarı Altyapısı Sürekliliği Desteği
Project Supported by Higher Education Institutions
ARIKAN M. (Executive), ÇALIŞKAN M., TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A.
2025 - Present
2025 - Presentİstanbul Boğazındaki Mikroplastik Kirliliğinin Balık Mikrobiyomlarına Etkilerinin Entegre Multi-Omik Analizlerle İncelenmesi
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project
ARIKAN M. (Executive), MÜLAYİM A., TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A., ÇALIŞKAN M., ÇAĞLAR S.
2025 - Present
2025 - PresentKriptokrom1 proteini ikincil pakete bağlanan moleküllerin sirkadiyen saat üzerine olan etkilerinin hayvan modelinde incelenmesi, preklinik çalışma
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Other
ÇALIŞKAN M. (Executive), BARIŞ İ., KAVAKLI H., OKYAR A., ARIKAN M., ERÖZDEN A. A., et al.
2024 - Present
2024 - Present
Antarktik Toprak Mikrobiyotasında Kolorektal Kanser Tedavisinde Kullanılabilecek Aday Antikanser Peptitlerin Tespiti ve In Vitro Test Edilmesi
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project
ARIKAN M. (Executive), ÇALIŞKAN M., TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A., ŞANLI N. Ö., DEMİREL G.
2025 - 2026
2025 - 2026Asya kaplan sivrisineğinde Cry toksin etkinliği ile bağırsak mikrobiyotası arasındaki ilişkinin incelenmesi
TUBITAK Project , 1002 - Quick Support Program
Arikan M., Çalişkan M., Erözden A. A., Tavşanli N., Gün G.
2024 - 2026
2024 - 2026Biyolojik Saati Düzenleyen Bazı Moleküllerin Kanser Hücre Hatları Üzerindeki Etkinliğinin ve Moleküler Hedeflerinin Araştırılması
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP PhD
Çalışkan M., Tavşanlı N.
2024 - 2026
2024 - 2026
Evaluation of The Use of Targeted Antiproliferative Agents with Albumin-Bound Paclitaxel in Different Breast Cancer Cell Lines with Cellular Molecular and Bioinformatic Approaches
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Other
Topçul M. R. (Executive), Atalar F., Çetin İ., Tavşanlı N., Erözden A. A., Özgen Ö., et al.
2024 - 2025
2024 - 2025Antibakteriyel-Biyouyumlu 3B Basılı Salyangoz Müsini-Jelatin (MüJel) Bazlı Yara Örtülerinin Üretimi ve Karakterizasyonu
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project
Çalışkan M. (Executive), Arıkan M., Tavşanlı N., Erözden A. A.
2022 - 2024
2022 - 2024Green All Together
Erasmus Project , Erasmus+ KA2 Cooperation for Innovation and the Exchange of Good Practices, National Level
Aydın S. (Executive), Çalışkan M., Tavşanlı N., Erözden A. A.
2022 - 2023
2022 - 2023Haematococcus pluvialis ile zenginleştirilmiş vegan kefir ve hayvansal bazlı kefirlerin fonksiyonellik besleyicilik ve mikrobiyal çeşitlilik özelliklerinin araştırılması
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project
AYDIN S. (Executive), MÜDÜROGLU KIRMIZIBEKMEZ A., TAVŞANLI N., KAPLAN E. B.
Congress and Symposium Activities
11 November 2015 - 13 November 2015
11 November 2015 - 13 November 2015International ITU MBG Student Congress'15
Attendee
İstanbul-Turkey
10 October 2014 - 12 October 2014
10 October 2014 - 12 October 2014