Metrikler
Yayın
82
Açık Erişim
3
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
Eğitim Bilgileri
2004 - 2011
2004 - 2011Doktora
İstanbul Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Ve Genetik, Türkiye
2000 - 2004
2000 - 2004Yüksek Lisans
İstanbul Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Ve Genetik, Türkiye
1996 - 2000
1996 - 2000Lisans
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji, Türkiye
Yaptığı Tezler
2011
2011Doktora
Astragalus chyrsochlorus’da Selenyum Birikimine İlişkin Moleküler Çalışmalar
İstanbul Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Ve Genetik
2004
2004Yüksek Lisans
Kimyasal Kültürleme Koşullarının Astragalus chrysochlorus Hücre Süspansiyon Kültürleri Üzerindeki Çeşitli Etkilerinin İncelenmesi
İstanbul Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Ve Genetik
Yabancı Diller
B2 Orta Üstü
B2 Orta Üstüİngilizce
Araştırma Alanları
Yaşam Bilimleri
Bitki Biyolojisi
Bitki Doku Kültürü
Bitki Histolojisi ve Sitolojisi
Biyoteknoloji
Bitki Biyoteknolojisi
Moleküler Biyoloji ve Genetik
Genetik Mühendisliği
Genomiks
Temel Bilimler
Akademik Ünvanlar / Görevler
2022 - Devam Ediyor
2022 - Devam EdiyorProf. Dr.
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
2017 - 2022
2017 - 2022Doç. Dr.
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
2003 - 2017
2003 - 2017Araştırma Görevlisi
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
2001 - 2003
2001 - 2003Araştırma Görevlisi
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü
Akademi Dışı Deneyim
2011 - 2017
2011 - 2017Genel Müdür
Sativa Biyoteknoloji, Genel Müdür
Yönetilen Tezler
2025
2025Doktora
Arabidopsis thaliana'DA KOMBİNE KURAKLIK VE AZOT AÇLIĞI İLE İLİŞKİLİ MİKRORNALARIN TRANSKRİPTOMİK ANALİZLERİ.
Çakır Ö. (Danışman)
E.LEMNYUY(Öğrenci)
2024
2024Yüksek Lisans
Arabidopsis thaliana ve lycopersicon esculentum bitkilerinde tekrarlanan kuraklık ve tuzluluk koşullarında RD29A/B genlerinin anlatım seviyelerinin incelenmesi
Çakır Ö. (Danışman)
A.HARUN(Öğrenci)
2022
2022Yüksek Lisans
Domates (Lycopersicon esculentum) bitkisinde endoplazmik retikulum (ER) stresi koşullarında gen anlatım analizleri
Çakır Ö. (Danışman)
E.PULAT(Öğrenci)
2021
2021Yüksek Lisans
Arabidopsis thaliana 'da Azot Açlığı ve Kuraklık Streslerinin MikroRNA Anlatımları Üzerindeki Etkilerinin Araştırılması
Çakır Ö. (Danışman)
S.Yaşar(Öğrenci)
2021
2021Doktora
Investigation of the effects of cycloastragenol on arabidopsis thaliana by high-throughput sequencing
Çakır Ö. (Eş Danışman), Nalbantoğlu B.
W.MHIRI(Öğrenci)
2020
2020Yüksek Lisans
Proteozom İnhibisyonunun Domates Üzerindeki Etkilerinin Araştırılması
Çakır Ö. (Danışman)
B.Karpuz(Öğrenci)
Makaleler
Tümü (35)
SCI-E, SSCI, AHCI (31)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (31)
Scopus (29)
TRDizin (1)
Diğer Yayınlar (3)
2026
20261. Epigenetic and transcriptomic features of stress memory during salt-stress priming in arabidopsis
ARIKAN B., ÇAKIR Ö., Kara N.
PLANT SCIENCE
, cilt.362, 2026 (SCI-Expanded)
2025
20252. Small RNA sequencing reveals important miRNA function in Arabidopsis thaliana calli in response to combined drought and nitrogen deficiency
Wirsiy E. L., Pulat E., Arslantürk A. H., Yaşar S., Çakır Ö.
Acta Botanica Brasilica , cilt.1, ss.1-22, 2025 (Hakemli Dergi)
2025
20253. ANTHOCYANIN ACCUMULATION AND GENE EXPRESSION ANALYSIS IN BLACK CARROT CALLI UNDER SALT AND SALICYLIC ACID STRESSES
Odabasi B., Sebikbay S., Uner A., Yildirim-Bastemur G., Pekmez M., Perçin Özkorucuklu S., et al.
JOURNAL OF ANIMAL AND PLANT SCIENCES-JAPS
, cilt.35, sa.2, ss.445-457, 2025 (SCI-Expanded)
2024
20244. Effects of nitrogen deficiency and drought stresses on miRNA expressions in Arabidopsis thaliana
Yaşar S., Pulat E., ÇAKIR Ö.
PLANT CELL TISSUE AND ORGAN CULTURE
, cilt.157, sa.2, 2024 (SCI-Expanded)
2024
20245. Transcriptome-wide analysis reveal dynamic expression changes during endoplasmic reticulum stress in tomato
Pulat E., ÇAKIR Ö.
PLANT BIOSYSTEMS
, cilt.158, sa.6, ss.1455-1467, 2024 (SCI-Expanded)
2023
20236. Transcriptomic analysis of salt stress induced chlorophyll biosynthesis-related genes in photoheterotrophic Arabidopsis thaliana calli
Çelik H., Arıkan B., Kara N., Uçarlı C., Çakır Ö.
FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS
, cilt.23, sa.2, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
20237. Analysis of microRNAs in response to cycloastragenol by small RNA sequencing in Arabidopsis thaliana
Mhiri W., Turgut Kara N., Nalbantoğlu B., Çakır Ö.
PLANT BIOTECHNOLOGY REPORTS
, cilt.17, sa.2, ss.213-228, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
20228. Synthesis and characterization of amino functional poly(acrylamide) coated Fe3O4 nanoparticles and investigation of their potential usage in DNA isolation
Yıldırım E., Arıkan B., Yücel O., Çakır Ö., Turgut Kara N., İyim T. B., et al.
CHEMICAL PAPERS
, cilt.76, ss.5747-5759, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
20219. Assessing the influence of cycloastragenol on telomere/telomerase system of Arabidopsis thaliana
Ceylan M., KINA Ü. Y., Cakir O., Kara N. T.
PLANT CELL TISSUE AND ORGAN CULTURE
, cilt.146, ss.83-95, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
202110. Arabidopsis thaliana GTS1 transcripts are activated by yeast extract
ARIKAN B., Semerci A., ÇAKIR Ö., Kara N. T.
BOTANICA SERBICA
, cilt.45, sa.2, ss.195-201, 2021 (SCI-Expanded)
2021
202111. Transcriptome sequencing and screening of genes related to glucose availability in Schizosaccharomyces pombe by RNA-seq analysis
Tarhan Ç., Çakır Ö.
GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY
, cilt.44, sa.3, 2021 (SCI-Expanded)
2021
202112. Expression analysis of miRNAs and their targets related to salt stress in Solanum lycopersicum H-2274
ÇAKIR Ö., ARIKAN B., Karpuz B., Turgut-Kara N.
BIOTECHNOLOGY & BIOTECHNOLOGICAL EQUIPMENT
, cilt.35, sa.1, ss.283-290, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
202013. Transcriptomic analysis reveals responses to Cycloastragenol in Arabidopsis thaliana.
Mhiri W., Ceylan M., Turgut-Kara N., Nalbantoğlu B., Çakır Ö.
PloS one
, cilt.15, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2019
201914. Nutritional and health benefits of legumes and their distinctive genomic properties
Cakir O., Ucarli C., Tarhan C., Pekmez M., Turgut-Kara N.
FOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY
, cilt.39, sa.1, ss.1-12, 2019 (SCI-Expanded)
2018
201815. IDENTIFICATION AND PRODUCTION OF PHENOLIC NICOTIFLORIN IN ASTRAGALUS CHRYSOCHLORUS CALLUS
Turgut-Kara N., Cakir Ö., Hasancebi S., Karabey F., Ari S.
FARMACIA
, cilt.66, sa.3, ss.558-562, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)
2018
201816. Molecular cloning and biotic elicitation response of phenylalanine ammonia-lyase gene of Astragalus chrysochlorus.
Turgut-Kara N., Cakir O., Arikan B., Ari S.
Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France)
, cilt.64, sa.5, ss.102-106, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)
2017
201717. Manipulating Selenium Metabolism in Plants: A Simple Twist of Metabolic Fate Can Alter Selenium Tolerance and Accumulation
Van Hoewyk D., Cakir O.
SELENIUM IN PLANTS: MOLECULAR, PHYSIOLOGICAL, ECOLOGICAL AND EVOLUTIONARY ASPECTS
, cilt.11, ss.165-176, 2017 (SCI-Expanded)
2017
201718. GMO Analysis Methods for Food: From Today to Tomorrow
Cakir O., Meric S., Ari S.
FOOD SAFETY: INNOVATIVE ANALYTICAL TOOLS FOR SAFETY ASSESSMENT
, ss.123-178, 2017 (SCI-Expanded)
2016
201619. Molecular cloning of cDNA encoding WD40 repeat sequences from Legume Species
Arıkan B., ÇAKIR Ö., TURGUT KARA N.
Journal of Molecular Biology and Genetics , cilt.1, sa.1, ss.27-32, 2016 (Hakemli Dergi)
2016
201620. Transcriptional Regulation of MicroRNA-targeting Genes in Tomato Response to Drought Stress.
Candar-Cakir B., Cakir O., Arican E., Zhang B.
IN VITRO CELLULAR & DEVELOPMENTAL BIOLOGY-ANIMAL
, 2016 (SCI-Expanded)
2016
201621. Selenium induced selenocysteine methyltransferase gene expression and antioxidant enzyme activities in Astragalus chrysochlorus
Cakir O., Turgut-Kara N., Ari S.
ACTA BOTANICA CROATICA
, cilt.75, sa.1, ss.11-16, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)
2016
201622. Small RNA and degradome sequencing reveals important microRNA function in Astragalus chrysochlorus response to selenium stimuli
Cakir O., Candar-Cakir B., Zhang B.
PLANT BIOTECHNOLOGY JOURNAL
, cilt.14, sa.2, ss.543-556, 2016 (SCI-Expanded)
2015
201523. De Novo Transcriptome Assembly and Comparative Analysis Elucidate Complicated Mechanism Regulating Astragalus chrysochlorus Response to Selenium Stimuli
Cakir O., Turgut-Kara N., Ari S., Zhang B.
PLOS ONE
, cilt.10, sa.10, 2015 (SCI-Expanded, Scopus)
2015
201524. SYNTHESIS AND CHARACTERIZATION OF COPOLYMERIC AND TERPOLYMERIC HYDROGEL-SILVER NANOCOMPOSITES BASED ON ACRYLIC ACID, ACRYLAMIDE AND ITACONIC ACID: INVESTIGATION OF THEIR ANTIBACTERIAL ACTIVITY AGAINST GRAM-NEGATIVE BACTERIA
Bal A., Cepni F. E., Cakir O., Acar I., Guclu G.
BRAZILIAN JOURNAL OF CHEMICAL ENGINEERING
, cilt.32, sa.2, ss.509-518, 2015 (SCI-Expanded)
2015
201525. Comparative phylogenetic analysis of phenylpropanoid metabolism genes of legume plants
TURGUT KARA N., ÇAKIR Ö.
PLANT OMICS
, cilt.8, sa.1, ss.55-61, 2015 (Scopus)
2014
201426. Detection of genetically modified organisms in soy products sold in Turkish market
Mandaci M., Cakir O., Turgut-Kara N., Meric S., Ari Ş.
FOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY
, cilt.34, sa.4, ss.717-722, 2014 (SCI-Expanded, Scopus)
2014
201427. Evaluation of biological activities of Physalis peruviana ethanol extracts and expression of Bcl-2 genes in HeLa cells
Cakir O., Pekmez M., Cepni E., Candar B., Fidan K.
FOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY
, cilt.34, sa.2, ss.422-430, 2014 (SCI-Expanded)
2014
201428. Detection of genetically modified maize and soybean in feed samples
Meric S., Cakir O., Turgut-Kara N., Ari S.
GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH
, cilt.13, sa.1, ss.1160-1168, 2014 (SCI-Expanded, Scopus)
2013
201329. Cloning and molecular characterization of selenocysteine methyltransferase (AchSMT) cDNA from Astragalus chrysochlorus
Cakir O., Ari S.
PLANT OMICS
, cilt.6, sa.2, ss.100-106, 2013 (SCI-Expanded)
2012
201230. Effects of Geven root extract on proliferation of HeLa cells and bcl-2 gene expressions
Özcan Arıcan G., Çakır Ö., Arıcan E., Turgut Kara N., Dağdeviren Ö., Arı Ş., et al.
AFRICAN JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY , cilt.11, sa.18, ss.4296-4304, 2012 (Hakemli Dergi)
2012
201231. Selenium Metabolism in Plants: Molecular Approaches
Cakir O., Turgut-Kara N., Ari S.
ADVANCES IN SELECTED PLANT PHYSIOLOGY ASPECTS
, ss.209-232, 2012 (SCI-Expanded)
2011
201132. Micropropagation and root culture of Turkish endemic Astragalus chrysochlorus (Leguminosae)
Hasancebi S., Kara N. T., Cakir O., Ari Ş.
TURKISH JOURNAL OF BOTANY
, cilt.35, sa.2, ss.203-210, 2011 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)
2010
201033. Selenium tolerance in Astragalus chrysochlorus: identification of a cDNA fragment encoding a putative Selenocysteine methyltransferase
Ari S., Cakir O., Turgut-Kara N.
ACTA PHYSIOLOGIAE PLANTARUM
, cilt.32, sa.6, ss.1085-1092, 2010 (SCI-Expanded, Scopus)
2009
200934. Defensive and secondary metabolism in Astragalus chrysochlorus cell cultures, in response to yeast extract stressor
Cakir O., Ari S.
JOURNAL OF ENVIRONMENTAL BIOLOGY
, cilt.30, sa.1, ss.51-55, 2009 (SCI-Expanded)
2007
200735. Cytotoxic activity of crude extracts from Astragalus chrysochlorus (Leguminosae)
Karagoz A., Turgut-Kara N., Cakir O., Demirgan R., Ari S.
BIOTECHNOLOGY & BIOTECHNOLOGICAL EQUIPMENT
, cilt.21, sa.2, ss.220-222, 2007 (SCI-Expanded, Scopus)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2022
20221. ANALYZING OF ANTHOCYANIN ACCUMULATION AND GROWTH RATIOS OF Black carrot SSP. CALLUS UNDER THE SALICYLIC ACID AND SALINITY STRESSES
Odabaşı B., Şebikbay S., Pulat E., Çakır Ö.
III. International Agricultural, Biological & Life Science Conference, Edirne, Türkiye, 29 - 31 Ağustos 2022, ss.536, (Özet Bildiri)
2022
20222. EFFECT OF ER STRESS ON VARIOUS MIRNA EXPRESSIONS IN TOMATO
Pulat E., Arslantürk A. H., Çakır Ö.
III. International Agricultural, Biological & Life Science Conference, Edirne, Türkiye, 29 - 31 Ağustos 2022, ss.268, (Özet Bildiri)
2019
20193. Puccinellia distans - A potential plant to reveal boron toxicity and salt tolerance mechanisms
Hakki E. E., Pandey A., Khan M. K., Hamurcu M., Celik O., Gezgin S., et al.
European Biotechnology Congress, Valencia, İspanya, 11 - 13 Nisan 2019, cilt.305, (Özet Bildiri)
2019
20194. miRNA Expression Analysis Under Salt Stress in H2274 Solanum lycopersicum
Arıkan B., Karpuz B., Turgut Kara N., Çakır Ö.
2nd International conference on Plant and Molecular Biology (PMB 2019) , Amsterdam, Hollanda, 23 - 25 Ekim 2019, ss.68, (Özet Bildiri)
2019
20195. Determination of the effect of curcumin on superoxide dismutase and catalase activity in tomato
Yaşar S., Hatipoğlu D., Karpuz B., ÇAKIR Ö.
7th international congress of The molecular Biology association of Turkey, İstanbul, Türkiye, 27 - 29 Eylül 2019, ss.25, (Tam Metin Bildiri)
2019
20196. Effect of beta-hydroxybutyrate in aging process Schizosaccharomyces pombe
Uludağ H., TARHAN Ç., ÇAKIR Ö., Ataözü M.
7th international congress of The molecular Biology association of Turkey, İstanbul, Türkiye, 27 - 29 Eylül 2019, ss.81, (Tam Metin Bildiri)
2019
20197. Cytotoxicity and AntibacterialActivity of Silk Fibroin Based Wound Dressing Films Incorporated with Ginger Extract
Özbaş Z., Bal Öztürk A., Püren Akgüner Z., Özgen S., Özkahraman B., ÇEPNİ YÜZBAŞIOĞLU F. E., et al.
Brightlands Rolduc Polymer Conference, Kerkrade, Hollanda, 9 - 11 Eylül 2019, ss.1, (Tam Metin Bildiri)
2019
20198. Does GTS1 has an important role under stress conditions in Arabidopsis?
Arıkan B., Semerci A., Ceylan R. M., Çakır Ö., Turgut Kara N.
International Conference on Plant, Cellular and Molecular Biology, Valencia, İspanya, 18 - 20 Şubat 2019, ss.28, (Özet Bildiri)
2018
20189. miRNA expression and salt stress relation in H2274 Solanum lycopersicum
Arıkan B., Karpuz B., Isin S., Turgut Kara N., Çakır Ö.
international eurasian conference on biological and chemical sciences (eurasianbiochem 2018), Ankara, Türkiye, 26 - 27 Nisan 2018, ss.760, (Özet Bildiri)
2015
201510. Bioactive properties of Turkish Endemic Astragalus chrysochlorus
ARI Ş., Hasançebi S., TURGUT KARA N., ÇAKIR Ö.
Drug Discovery and Therapy World Congress 2015, Boston, Amerika Birleşik Devletleri, 22 - 25 Temmuz 2015, cilt.1, sa.1, ss.45, (Özet Bildiri)
2014
201411. Transcriptomic analysis on Endemic Astragalus chrysoclorus Calli in Response to Selenium Treatment
ÇAKIR Ö., Turgut Kara N., ARI Ş.
Genom Varyasyonları: Uygulama ve Veri Analizleri Sempozyumu Uluslararası katılımlı., İstanbul, Türkiye, 15 - 16 Eylül 2014, ss.17, (Tam Metin Bildiri)
2014
201412. An Overview to Elucidation of the Gene Expression in Crocus sativusL. by High Throughput Analysis.
ÇAKIR Ö.
Genom Varyasyonları: Uygulama ve Veri Analizleri Sempozyumu, İstanbul, Türkiye, 15 - 16 Eylül 2014, ss.18, (Tam Metin Bildiri)
2013
201313. Antibacterial and antioxidant activities of Physalis peruviana
Pekmez M., ÇEPNİ F. E., Candar Çakır B., Çakır Ö.
5th Central European Congress of Life Sciences, Krakow, Polonya, 8 - 11 Ekim 2013, ss.38, (Tam Metin Bildiri)
2013
201314. Bcl-2 family gene expression on HeLa cells treated with Physalis peruviana ethanol extracts
ÇAKIR Ö., Candar Çakır B., Pekmez M., Fidan K.
V th Central European Congress of Life Sciences, Polonya, 1 - 04 Ekim 2013, ss.38, (Tam Metin Bildiri)
2013
201315. Hydrogel-Silver Nanocomposites for Antibacterial Applications", 8th International Conference on the Environmental Effects of Nanoparticles and Nanomaterials (Nano 2013)
BAL A., ÇEPNİ F. E., ÇAKIR Ö., ACAR I., GÜÇLÜ G.
Aix-Marseille University, (Uluslararası), Aix-En-Provence, Fransa, 1 - 04 Temmuz 2013, (Tam Metin Bildiri)
2013
201316. Hydrogel-Silver Nanocomposites For Antibacterial Applications
BAL A., Çepni F. E., ÇAKIR Ö., ACAR I., GÜÇLÜ G.
8th International Conference On The Environmental Effects Of Nanoparticles And Nanomaterials, 2013, Marseille, Fransa, 1 - 04 Temmuz 2013, ss.126, (Özet Bildiri)
2013
201317. Cytotoxic Effects Of Physalis Peruviana Ethanol Extracts On Hela Cells
Fidan K., Candar Çakır B., PEKMEZ M., ÇAKIR Ö.
1st Mediterranean Symposium on Medicinal and Aromatic Plants (MESMAP-2013), Kıbrıs (Kktc), 1 - 04 Nisan 2013, ss.240, (Tam Metin Bildiri)
2011
201118. Analysis of two phenylpropanoid genes in Astragalus chrysochlorus
Kara N. T., Cakir O., Ari S.
European Biotechnology Congress, İstanbul, Türkiye, 28 Eylül - 01 Ekim 2011, cilt.22, (Özet Bildiri)
2010
201019. Astragalus chrysochlorus’da Selenyum Birikimine İlişkin Ayrım Katsayısının Hesaplanması
ÇAKIR Ö., Çakmak İ., ARI Ş.
16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 1 - 04 Ocak 2010, ss.12-13, (Tam Metin Bildiri)
2010
201020. Arpa (Hordeum vulgare L.)’nın farklı çeşit ve eksplantlarında in vitro rejenerasyon kapasitesi
Yörük E., Çepni E., ÇAKIR Ö., Albayrak G., ARI Ş., Gürel F.
16. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 1 - 04 Ocak 2010, ss.106-107, (Tam Metin Bildiri)
2009
200921. Astragalus chrysochlorus’da Selenyum Birikimine İlişkin Ayrım Katsayısının Hesaplanması
ÇAKIR Ö., Çakmak İ., ARI Ş.
XVI. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 1 - 04 Aralık 2009, ss.12-13, (Özet Bildiri)
2009
200922. Arpa (Hordeum vulgare L.)’nın farklı çeşit ve eksplantlarında in vitro rejenerasyon kapasitesi
Yörük E., Çepni E., ÇAKIR Ö., ALBAYRAK G., ARI Ş., GÜREL F.
XVI. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 1 - 04 Aralık 2009, ss.106-109, (Tam Metin Bildiri)
2009
200923. Geven (Astragalus chrysochlorus) kök ekstresinin apoptoz etkisinin moleküler düzeyde araştırılması
Özcan Arıcan G., ÇAKIR Ö., ARICAN E., Turgut Kara N., dağdeviren Ö., ARI Ş., et al.
XI: Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, Muğla, Türkiye, 1 - 04 Ekim 2009, ss.172, (Özet Bildiri)
2009
200924. Selenocysteine Se-methyltransferase gene in Astragalus chrysochlorus
Ari S., Cakir O.
34th Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies, Prague, Çek Cumhuriyeti, 4 - 09 Temmuz 2009, cilt.276, ss.272, (Özet Bildiri)
2008
200825. Detection of genetically modified soy in processed foods sold commercially in Turkey by PCR-based method
ARI Ş., ÇAKIR Ö.
1st Global conference on GMO Analysis, İtalya, 1 - 04 Haziran 2008, ss.55, (Tam Metin Bildiri)
2007
200726. Astragalus chrysochlorus’da Selenosistein Metil Transferaz Geninin Moleküler Analizi
ARI Ş., Turgut Kara N., ÇAKIR Ö., Şenol N. Ö., KARA N. T.
XV. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 1 - 04 Ekim 2007, ss.115-117, (Tam Metin Bildiri)
2007
200727. Astragalus chrysochlorus’a süspansiyon kültürlerinde maya özütünün hücre canlılığı üzerindeki etkisi
ÇAKIR Ö., Turgut Kara N., ARI Ş., KARA N. T.
XV. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 1 - 04 Ekim 2007, ss.17, (Tam Metin Bildiri)
2007
200728. Selenium accumulation in Astragalus chrysochlorus
Ari S., Senol N. O., Cakir O., Kara N. T.
13th European Congress on Biotechnology (ECB 13), Barcelona, İspanya, 16 - 19 Eylül 2007, cilt.131, (Özet Bildiri)
2006
200629. Endemik Astragalus chrysochlorus’da biyoteknolojik çalışmalar
Arı Ş., Turgut Kara N., Çakır Ö., Hasançebi S., Şenol N. Ö.
Biyoteknoloji Yüzyılı ve Türkiye Kongresi, İstanbul, Türkiye, 3 - 04 Haziran 2006, ss.26, (Özet Bildiri)
2006
200630. Effect of yeast extract and chitosan on the phenylalanine ammonia lyase activity and production of total phenolics on Astragalus chrysochlorus cell suspension cultures
ÇAKIR Ö., ARI Ş.
IV Balkan Botanical Congress, Bulgaristan, 1 - 04 Haziran 2006, ss.284, (Tam Metin Bildiri)
2006
200631. Cytotoxic activity of crude extracts from Astragalus chrysochlorus
ARI Ş., Karagöz A., Turgut Kara N., ÇAKIR Ö., KARA N. T.
IV Balkan Botanical Congress, Bulgaristan, 1 - 04 Haziran 2006, ss.280, (Tam Metin Bildiri)
2005
200532. Maya özütünün Astragalus chrysochlorus hücre süspansiyon kültürlerinde fenil alanin amonyum liyaz aktivitesi üzerine etkisinin araştırılması
ÇAKIR Ö., ARI Ş.
XIV Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Eskişehir, Türkiye, 1 - 04 Ağustos 2005, ss.590, (Tam Metin Bildiri)
2004
200433. Astragalus chrysochlorus hücre süspansiyon kültürlerinde sekonder metabolit üretiminde pH, amonyum nitrat, maya özütünün etkileri
ÇAKIR Ö., ARI Ş.
XVII: Ulusal Biyoloji Kongresi, Adana, Türkiye, 1 - 04 Haziran 2004, ss.17, (Tam Metin Bildiri)
2003
200334. Astragalus chrysochlorus’da saçak kök kültürlerinin kurulması
Hasançebi S., ÇAKIR Ö., Turgut Kara N., ARI Ş., KARA N. T.
XIII. Biyoteknoloji Kongresi, Çanakkale, Türkiye, 1 - 04 Ağustos 2003, ss.89, (Özet Bildiri)
2003
200335. Astragalus chrysochlorus’a elektroporasyon yoluyla gen aktarımı çalışmaları
Turgut Kara N., Şahin Hasançebi S., ÇAKIR Ö., ARI Ş., KARA N. T.
XIII. Biyoteknoloji Kongresi, Çanakkale, Türkiye, 1 - 04 Ağustos 2003, ss.102, (Tam Metin Bildiri)
2003
200336. Kültürleme koşullarının Astragalus chrysochlorus hücre süspansiyon kültürleri üzerindeki etkileri
ÇAKIR Ö., Turgut Kara N., Şahin Hasançebi S., ARI Ş., KARA N. T.
XIII. Biyoteknoloji Kongresi, Çanakkale, Türkiye, 1 - 04 Ağustos 2003, ss.88, (Tam Metin Bildiri)
2002
200237. Fiziksel Kültürleme Koşullarının Astragalus chrysochlorus saçak kök kültürleri üzerindeki etkileri
ÇAKIR Ö., Şahin Hasançebi S., ARI Ş.
XVI.Ulusal Biyoloji Kongresi, Malatya, Türkiye, 1 - 04 Eylül 2002, ss.171, (Tam Metin Bildiri)
Kitaplar
2025
20251. Plant Stress Priming: The Role of Epigenetic Regulation
Arıkan B., Pulat E., Çakır Ö., Turgut Kara N.
Epigenetics for Climate-Smart and Sustainable Agriculture, JEN-TSUNG CHEN, Editör, Cabi Publishing-C A B Int, London, ss.519-535, 2025
2025
20252. The Role of Plant Epigenetic Memory Mechanisms in Abiotic Stress Tolerance
Turgut Kara N., Arıkan B., Pulat E., Çakır Ö.
Epigenetics for Climate-Smart and Sustainable Agriculture, JEN-TSUNG CHEN, Editör, Cabi Publishing-C A B Int, London, ss.41-60, 2025
2025
20253. Abiotic Stress Tolerance through CRISPR/Cas9 Mediated Genome Editing in Tomato
Arıkan B., Pulat E., Turgut Kara N., Çakır Ö.
Gene-Edited Crops: The CRISPR Solution for Global Food Security, Aftab Ahmad,Nayla Munawar,Baohong Zhang, Editör, Routledge Curzon, London , London, ss.1-25, 2025
2024
20244. Distinctive Features Of Plant MicroRNAs In Response To Abiotic Stresses
Lemnyuy Wirsiy E., Çakır Ö.
The Broad Spectrum of Biological Sciences, Merve Yılmazer,Sevgi Maraklı, Editör, Gaziantep Üniversitesi Yayınevi, Gaziantep, ss.521-545, 2024
2017
20175. Manipulating Selenium Metabolism in Plants: A Simple Twist of Metabolic Fate can Alter Selenium Tolerance and Accumulation
Van Hoewyk D., ÇAKIR Ö.
Selenium in plants: Molecular, Physiological, Ecological and Evolutionary Aspects, Elizabeth Pilon-Smits, Lenny Winkel, Zhi-Qing (ZQ) Lin, Editör, Springer, London/Berlin , Cham, ss.165-176, 2017
2017
20176. GMO analysis methods in Food: From Today To Tomorrow
ÇAKIR Ö., Meriç S., ARI Ş.
Food Safety: Innovative Analytical Tools for Safety Assessment, SPİZZİRRİ U G, CİRİLLO G, Editör, Scrivener Publishing Llc, Beverly, ss.123-163, 2017
2016
20167. miRNA Profi ling in Plants: Current Identification and Expression Approaches
Candar Çakır B., ÇAKIR Ö.
Plant Omics: Trends and Applications, Hakeem K.R., Tombuloğlu H., Tombuloğlu G., Editör, Springer, London/Berlin , Isviçre, ss.189-215, 2016
2015
20158. Detection of Genetically Modified Organisms in Feeds
ÇAKIR Ö., Meriç S., ARI Ş.
Genetically Modified Organisms in Food: Production, Safety, and Public Health, Watson R.R., Preedy V.R., Editör, Academic Press Elsevier Science, Oxford/Amsterdam, Oxford, ss.207-222, 2015
2012
20129. Selenium Metabolism in Plants: Molecular Approaches
ÇAKIR Ö., Turgut Kara N., ARI Ş.
Advances in Selected Plant Physiology Aspects, Montanaro G., Dichio B., Editör, Open Access Publisher, Rijeka, ss.209-232, 2012
Bilirkişi Raporları
2021
20211. Fikri ve Sınai Haklar- Biyoteknoloji
Çakır Ö.
Fikri ve Sınai Haklar, ss.80, İstanbul, 2021
Desteklenen Projeler
2022 - 2025
2022 - 2025
Arabidopsis thaliana'da kombine kuraklık ve azot açlığı ile ilişkili mikroRNAların transkriptomik analizleri
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), WIRSIY E. L.
2024 - 2024
2024 - 2024Lycopersicon esculentum bitkisinde UV-B stresi sonrası oskidatif stresle ilişkili genlerin anlatım miktarının araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), IM J., ALDEMİR Ş., ALKIŞ I.
2023 - 2024
2023 - 2024
Arabidopsis thaliana ve Lycopersicon esculentum bitkilerinde tekrarlanan kuraklık ve tuzluluk koşullarında RD29A/B genlerinin anlatım seviyelerinin incelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), ARSLANTÜRK A. H.
2022 - 2023
2022 - 2023Tuz ve Salisilik Asit Stresleri Uygulanmış Mor Havuç (Daucus carota ssp.) Kalluslarında Antosiyanin Biyosentezinde Görevli Genlerin Araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), GÜVEN B. G., ODABAŞI B., ŞEBİKBAY S.
2021 - 2023
2021 - 2023Domates (Lycopersicon esculentum) bitkisinde endoplazmik retikulum (ER) stresi koşullarında gen anlatım analizleri
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), PULAT E.
2021 - 2023
2021 - 2023Arabidopsis thalianada Tuz Stresi Hafızasına İlişkin Transkriptomik Analizler
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), TURGUT KARA N., ARIKAN B.
2021 - 2022
2021 - 2022
Kuraklık Stresinde Arabidopsis thalianada DEADbox ATPye bağımlı RNA helikaz 39 ve Alkalineneutral invertase C genlerinin gradient PCR ile çoğaltılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), NAZ A. N., KİLECİOĞLU B. K.
2021 - 2022
2021 - 2022Mor ve Turuncu Havuç Bitkilerinde Doku Kültürü Kurulması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), ODABAŞI B., YANMAZ E. H., ŞEBİKBAY S.
2021 - 2021
2021 - 2021
Arabidopsis thaliana'da Azot Açlığı ve Kuraklık Streslerinin MikroRNA Anlatımları Üzerindeki Etkilerinin Araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), YAŞAR S.
2020 - 2021
2020 - 2021DNA Hasarı Üzerine Silikonun Hafifletici Etkisinin Araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), BARANSEL G. Ş.
2019 - 2021
2019 - 2021
Azot Açlığı ve Kuraklık Kombine Stresinde Arabidopsis thaliana Bitkisinde MikroRNA Anlatımlarının Araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), HANÇER H., PULAT E., GÜL D.
2019 - 2020
2019 - 2020
Proteozom İnhibisyonunun Domates Üzerindeki Etkilerinin Araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
(Proje Özeti)
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), KARPUZ B.
2018 - 2020
2018 - 2020Domateste Tuz Stresi İle İlişkili mikroRNAların ve Hedef Genlerinin Anlatım Analizi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), KARPUZ B., ARIKAN B., TURGUT KARA N.
2018 - 2019
2018 - 2019Beta-Hidroksibütiratın Schizosaccharomyces pombe hücrelerinin senesensi üzerindeki etkisi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), ATAÖZÜ M.
2018 - 2019
2018 - 2019Domates Bitkisinde Kurkuminin Antioksidan Enzim Aktivitesine Etkisi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), HATİPOĞLU D., YAŞAR S.
2018 - 2019
2018 - 2019DNA Methylation related gene expression and morphophysiological response to abiotic stresses in Arabidopsis thaliana
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
TURGUT KARA N. (Yürütücü), ÖZDEN S., ARIKAN B., ÇAKIR Ö.
2017 - 2019
2017 - 2019Aubrieta ekimiinin Çeşitli Biyolojik Aktivitelerinin Araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇEPNİ YÜZBAŞIOĞLU F. E. (Yürütücü), YÜZBAŞIOĞLU İ. S., TURGUT KARA N., ÇAKIR Ö., PEKMEZ M., ARIKAN B., et al.
2017 - 2019
2017 - 2019NextGeneration Sequencing Advantages Disadvantages and Future
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ARI Ş. (Yürütücü), ARIKAN M., ÇAKIR Ö., MERİÇ S.
2018 - 2018
2018 - 2018Ammi visnaga doku kültürü kurulması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), İŞİN Ş.
2017 - 2018
2017 - 2018Arabidopsis'te NaCl'nin Pigment Metabolizması Üzerindeki Etkisinin Transkriptomik Düzeyinde İncelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
TURGUT KARA N. (Yürütücü), ARIKAN B., UÇARLI C., ÇAKIR Ö.
2017 - 2017
2017 - 2017Selenium Induced Selenocysteine Methyltransferase Gene Expression And Antioxidant Enzyme Activities In Astragalus Chrysochlorus
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇAKIR Ö. (Yürütücü), TURGUT KARA N., ARI Ş.
2016 - 2017
2016 - 2017Baklagil bitkilerinde fenilpropanoid metabolizmasını moleküler olarak test etmek için kullanılacak tek aşamalı kit
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
TURGUT KARA N. (Yürütücü), ÇAKIR Ö.
2016 - 2016
2016 - 2016Atık PET'in farklı glikoller ile depolimerizasyonu ve ürün özelliklerinin incelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ACAR I. (Yürütücü), ÇEPNİ YÜZBAŞIOĞLU F. E., ÇAKIR Ö., BAL ÖZTÜRK A., TAHMAZ M., GÜÇLÜ G.
2015 - 2016
2015 - 2016Yaşlanmayla Birlikte Gerçekleşen Metabolik Değişimlerin RNA-dizileme Yöntemi Kullanılarak Genom Ölçeğinde İncelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
TARHAN Ç. (Yürütücü), ÇAKIR Ö.
2014 - 2016
2014 - 2016Yüksek verimlilikte safran üretimi için Moleküler analizler ile süreç geliştirilmesi
Diğer Özel Kurumlarca Desteklenen Proje
ÇAKIR Ö. (Yürütücü)
2014 - 2016
2014 - 2016Doğal ve in vitro koşullarda üretilen A. chrysochlorus bitkisel materyallerinde Fenolik Madde İçeriklerinin Tanımlanması, Karşılaştırılması ve Miktarlarının Belirlenmesine Yönelik Analizler
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
TURGUT KARA N. (Yürütücü), ÇAKIR Ö., ARI Ş.
2013 - 2016
2013 - 2016MOLEKÜLER BİYOTEKNOLOJİ LABORATUVARININ KURULMASI
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Güdümlü
ARDA E. Ş. N. (Yürütücü), UÇARLI C., ARICAN E., ALBAYRAK G., GÜREL A. F., ARI Ş., et al.
2014 - 2015
2014 - 2015Astragalus chrysochlorus Kalluslarında Kodlama Yapmayan RNAların Analizi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇAKIR Ö. (Yürütücü)
2014 - 2015
2014 - 2015Endemik Astragalus chrysochlorus Kalluslarında Selenyum Varlığında Gen Anlatım Farklılığının Transkriptomik Analizi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇAKIR Ö. (Yürütücü)
2013 - 2013
2013 - 2013Antibacterial and Antioxidant activities of Physalis peruviana
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇAKIR Ö. (Yürütücü)
2012 - 2013
2012 - 2013Astragalus chrysochlorus'da Selenosistein metiltransferaz Geninin Kantitatif Analizi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇAKIR Ö. (Yürütücü)
2011 - 2012
2011 - 2012Doku Kültüründe Safran Üretimi
Diğer Resmi Kurumlarca Desteklenen Proje
ÇAKIR Ö. (Yürütücü)
Bilimsel Kuruluşlardaki Üyelikler / Görevler
2008 - Devam Ediyor
2008 - Devam EdiyorTürk Mikrobiyoloji Cemiyeti
Üye
2005 - Devam Ediyor
2005 - Devam EdiyorUlusal Biyokimya Derneği
Üye
Bilimsel Yayınlarda Hakemlikler
Şubat 2013
Şubat 2013Pharmaceutical Biology
SCI Kapsamındaki Dergi
Kongre ve Sempozyum Katılımı Faaliyetleri
29 Ağustos 2022 - 31 Ağustos 2022
29 Ağustos 2022 - 31 Ağustos 2022IV. INTERNATIONAL AGRICULTURAL, BIOLOGICAL & LIFE SCIENCE CONFERENCE
Katılımcı
Edirne-Türkiye
01 Ekim 2013 - 01 Ekim 2013
01 Ekim 2013 - 01 Ekim 2013V th Central European Congress of Life Sciences
Katılımcı
Krakow-Polonya
01 Nisan 2013 - 01 Nisan 2013
01 Nisan 2013 - 01 Nisan 20131st Mediterranean Symposium on Medicinal and Aromatic Plants (MESMAP-2013)
Katılımcı
-Kıbrıs (Kktc)
01 Eylül 2011 - 01 Eylül 2011
01 Eylül 2011 - 01 Eylül 2011European Biotechnology Congress 2011
Katılımcı
İstanbul-Türkiye
01 Aralık 2009 - 01 Aralık 2009
01 Aralık 2009 - 01 Aralık 200916. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi
Katılımcı
Antalya-Türkiye
01 Ekim 2009 - 01 Ekim 2009
01 Ekim 2009 - 01 Ekim 200911. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi
Katılımcı
Muğla-Türkiye
01 Temmuz 2009 - 01 Temmuz 2009
01 Temmuz 2009 - 01 Temmuz 200934. FEBS Kongresi
Katılımcı
Prag-Çek Cumhuriyeti
01 Haziran 2008 - 01 Haziran 2008
01 Haziran 2008 - 01 Haziran 20081. Global Conference on GMO Analysis
Katılımcı
Como-İtalya
01 Ekim 2007 - 01 Ekim 2007
01 Ekim 2007 - 01 Ekim 200715. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi
Katılımcı
Antalya-Türkiye
01 Eylül 2007 - 01 Eylül 2007
01 Eylül 2007 - 01 Eylül 200713. European Congress on Biotechnology
Katılımcı
Barcelona-İspanya
01 Haziran 2006 - 01 Haziran 2006
01 Haziran 2006 - 01 Haziran 20064. Balkan Botanik Kongresi
Katılımcı
Sofia-Bulgaristan
01 Ağustos 2005 - 01 Ağustos 2005
01 Ağustos 2005 - 01 Ağustos 200514. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi
Katılımcı
Eskişehir-Türkiye
01 Haziran 2004 - 01 Haziran 2004
01 Haziran 2004 - 01 Haziran 200417. Ulusal Biyoloji Kongresi
Katılımcı
ADANA-Türkiye
01 Ağustos 2003 - 01 Ağustos 2003
01 Ağustos 2003 - 01 Ağustos 200313. Biyoteknoloji Kongresi
Katılımcı
Çanakkale-Türkiye
01 Eylül 2002 - 01 Eylül 2002
01 Eylül 2002 - 01 Eylül 200216. Ulusal Biyoloji Kongresi
Katılımcı
Malatya-Türkiye
Burslar
2015 - 2015
2015 - 2015