Eğitim Bilgileri
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorÖn Lisans
İstanbul Üniversitesi, Açık ve Uzaktan Eğitim Fakültesi, Açık Öğretim Programları, Türkiye
2022 - 2024
2022 - 2024Post Doktora
Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Türkiye
2015 - 2021
2015 - 2021Doktora
Sivas Cumhuriyet Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Ve Genetik, Türkiye
2012 - 2015
2012 - 2015Yüksek Lisans
Sivas Cumhuriyet Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Ve Genetik, Türkiye
2008 - 2012
2008 - 2012Lisans
Sivas Cumhuriyet Üniversitesi, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü, Türkiye
Sertifika, Kurs ve Eğitimler
2024
2024Python İle Veri Bilimi Ve Makine Öğrenmesi
Bilişim
İstanbul Üniversitesi
2019
2019Illumina MiSeq sistemi
Mesleki Eğitim
Gen-Era Diagnostik A.Ş.
2019
2019BioOptic QSep100 Fragment Analyzer Sistemi
Mesleki Eğitim
Sightgen Sağlık Ürünleri
Araştırma Alanları
Biyoinformatik
Moleküler Biyoloji ve Genetik
Akademik Ünvanlar / Görevler
2023 - Devam Ediyor
2023 - Devam EdiyorDr. Öğr. Üyesi
İstanbul Üniversitesi, Su Bilimleri Fakültesi, Akuatik Biyoteknoloji ve Genomik Bölümü
Yönetilen Tezler
Devam ediyor
Devam ediyorYüksek Lisans
Ay Denizanasında Peyzaj Genetiği Çalışmalarında Kullanılabilecek Olası Bir Biyobelirteç: mtDNAcn
Aydemir M. N. (Eş Danışman), İşinibilir Okyar M.
S.Zeynep(Öğrenci)
Makaleler
Tümü (13)
SCI-E, SSCI, AHCI (10)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (11)
ESCI (2)
Scopus (11)
TRDizin (1)
Diğer Yayınlar (2)
2025
20251. Evaluating yield of DNA extraction methods across different tissues of moon jellyfish Aurelia aurita (Linnaeus, 1758)
ÇALICI S. Z., Bayrak B., YAVUZ H. B., Kelel N., Avşaroğlu Z. A., AYDEMİR M. N.
BIOLOGICAL DIVERSITY AND CONSERVATION , cilt.18, sa.3, ss.291-300, 2025 (Hakemli Dergi)
2025
20252. Machine Learning-Based Bioindicator Assessment: Driver Forces of Chironomidae Community Structure in the Eastern Black Sea Basin
Aydemir H. B., MERCAN D., ARSLAN N., AYDEMİR M. N.
Ecohydrology
, cilt.18, sa.5, 2025 (SCI-Expanded)
2025
20253. Comparative mitogenomics of Clitellata reveals mitogenome organization can affect the mode of phylogeny
MERCAN D., Horenkamp A., AYDEMİR M. N., Aydemir H. B., Neubig K., ARSLAN N., et al.
Turkish Journal of Zoology
, cilt.49, sa.4, ss.197-206, 2025 (SCI-Expanded)
2025
20254. New data on the lacewing fauna of Azerbaijan with special emphasis on mantidflies and antlions (Neuroptera: Mantispidae, Myrmeleontidae)
Kerimova I. G., Aydemir M. N.
ORIENTAL INSECTS
, cilt.59, sa.2, ss.247-276, 2025 (SCI-Expanded)
2023
20235. Differential sense and antisense expression profiles of Syrista parreyssi (Hymenoptera: Cephidae) mitochondrial transcripts
Aydemir H. B., Aydemir M. N., KORKMAZ E. M.
ARCHIVES OF INSECT BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY
, cilt.113, sa.4, 2023 (SCI-Expanded)
2023
20236. A novel, conserved and possibly functional motif ?WHWGHTW? in mitochondrial transcription across Bilateria
Aydemir M. N., Aydemir H. B., BUDAK M., Kiziltepe B., Celebi M. S., KORKMAZ E. M., et al.
MITOCHONDRION
, cilt.68, ss.72-80, 2023 (SCI-Expanded)
2022
20227. A DNA Barcode Library of Some Neuroptera from Azerbaijan
Kerimova I. G., Krivokhatsky V. A., Aydemir M. N., Mamedova L. N.
Punjab University Journal of Zoology , cilt.37, sa.2, ss.169-174, 2022 (Hakemli Dergi)
2021
20218. Computationally predicted SARS-COV-2 encoded microRNAs target NFKB, JAK/STAT and TGFB signaling pathways
Aydemir M. N., Aydemir H. B., KORKMAZ E. M., BUDAK M., ÇEKİN N., PINARBAŞI E.
GENE REPORTS
, cilt.22, 2021 (ESCI, Scopus)
2020
20209. Wingless ligands and beta-catenin expression in the rat endometrium: The role of Wnt3 and Wnt7a/beta-catenin pathway at the embryo-uterine interface
KALOĞLU C., BULUT H., HAMUTOĞLU R., KORKMAZ E. M., onder O., Dagdeviren T., et al.
MOLECULAR REPRODUCTION AND DEVELOPMENT
, cilt.87, sa.11, ss.1159-1172, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
202010. The regulation of trophoblast invasion and decidual reaction by matrix metalloproteinase-2, metalloproteinase-7, and metalloproteinase-9 expressions in the rat endometrium
HAMUTOĞLU R., BULUT H. E., KALOĞLU C., Onder O., Dagdeviren T., Aydemir M. N., et al.
REPRODUCTIVE MEDICINE AND BIOLOGY
, cilt.19, sa.4, ss.385-397, 2020 (SCI-Expanded)
2020
202011. Comparative mitogenomics of Hymenoptera reveals evolutionary differences in structure and composition
Aydemir M. N., KORKMAZ E. M.
INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES
, cilt.144, ss.460-472, 2020 (SCI-Expanded)
2019
201912. The first mitogenomes of the superfamily Pamphilioidea (Hymenoptera: Symphyta): Mitogenome architecture and phylogenetic inference
Niu G., KORKMAZ E. M., DOĞAN Ö., Zhang Y., Aydemir M. N., BUDAK M., et al.
INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES
, cilt.124, ss.185-199, 2019 (SCI-Expanded)
2016
201613. The complete mitogenomes of Calameuta filiformis (Eversmann, 1847) and Calameuta idolon (Rossi, 1794) (Hymenoptera: Cephidae): The remarkable features of the elongated A plus T rich region in Cephini
KORKMAZ E. M., BUDAK M., Ordek M. N., BAŞIBÜYÜK H. H.
GENE
, cilt.576, sa.1, ss.404-411, 2016 (SCI-Expanded)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2024
20241. Comprehensive Mitotranscriptomics of Life Cycle Reversal Stages of Immortal Jellyfish Turritopsis dohrnii (Cnidaria: Hydrozoa)
Aydemir M. N., Çalıcı S. Z., Işinibilir Okyar M.
3rd Aquatic Biotechnology Symposium , İstanbul, Türkiye, 25 - 27 Eylül 2024, (Yayınlanmadı)
2023
20232. TO THE STUDY OF SPECIES DIVERSITY OF MANTODEA IN AZERBAIJAN
Shahverdiyeva Z., AYDEMİR M. N.
International Conference Heydar Aliyev and the Development of Modern Biology: Achievements and Challenges, Baku, Azerbaycan, 19 Aralık 2023, (Özet Bildiri)
2022
20223. SIÇAN ENDOMETRİUMUNDA CAS-9, TCF VE LEF-1 İFADELERİ İLE HÜCRE TRANSKRİPSİYONU VE APOPTOZ REAKSİYONUNUN DÜZENLENMESİ
Dağdeviren T., BULUT H. E., KALOĞLU C., HAMUTOĞLU R., Önder O., AYDEMİR M. N., et al.
15th National and 1st International Congress of Histology and Embryology, Türkiye, 26 Mayıs 2022, (Özet Bildiri)
2022
20224. Possible roles of angiogenic factors in implantation, decidualization and placentation processes in the rat endometrium
Önder O., KALOĞLU C., HAMUTOĞLU R., BULUT H. E., Dağdeviren T., AYDEMİR M. N., et al.
15th National and 1st International Congress of Histology and Embryology, Türkiye, 26 Mayıs 2022, (Özet Bildiri)
2018
20185. A New Putative Transcription Termination Signal Which Interact Transcription Termination Factors In Ecdysozoa
Aydemir M. N., Aydemir H. B., Budak M., Korkmaz E. M., Başıbüyük H. H.
5th Ecology And Evolutionary Biology Symposium, İzmir, Türkiye, 18 - 20 Temmuz 2018, (Yayınlanmadı)
2018
20186. Identification Of Differentially Expressed Sense And Antisense Transcripts In Mitochondrial Genes Of Syrista Pareyyssi (hymenoptera: Cephidae)
Aydemir H. B., Aydemir M. N., Yangın S., Budak M., Korkmaz E. M., Başıbüyük H. H.
5th Ecology And Evolutionary Biology Symposium, İzmir, Türkiye, 18 - 20 Temmuz 2018, (Yayınlanmadı)
2018
20187. Wolbachia Infectiondetection In Diplolepis Fructuum (rübsaamen 1895) (hymenoptera: Cynipoidea) Population In Sivas, Turkey.
Aydemir M. N., Nail M. L.
Innovative Approaches In Modern Biology, Baku, Azerbaycan, 27 - 28 Nisan 2018, ss.27-29, (Tam Metin Bildiri)
2018
20188. Investigation On The Complete Mitogenome Of Neodiprion Sertifer (hymenoptera: Diprionidae)
Aydemir M. N., Aydemir H. B., Korkmaz E. M.
Innovative Approaches In Modern Biology, Baku, Azerbaycan, 27 - 28 Nisan 2018, ss.33-34, (Tam Metin Bildiri)
2016
20169. Differences Of Mitochondrial Rrna Genes Secondary Structure Prediction In Hymenoptera Order
Aydemir H. B., Aydemir M. N., Durel Avcıoğlu B. S., Budak M., Başıbüyük H. H., Çelebi M. Ş., et al.
3rd Ecology And Evolutionary Biology Symposium, Ankara, Türkiye, 31 Ağustos - 01 Ekim 2016, ss.65, (Tam Metin Bildiri)
2016
201610. Characterization Of The Mitochondrial Genome of Syrista parreyssi and Hartigia linearis
Aydemir H. B., Durel Avcıoğlu B. S., Aydemir M. N., Budak M., Korkmaz E. M., Başıbüyük H. H.
3rd Ecology And Evolutionary Biology Symposium, Ankara, Türkiye, 31 Ağustos - 01 Ekim 2016, ss.58, (Tam Metin Bildiri)
2016
201611. Evidence Of Relaxed Selection In Evolution Of Mitogenome For Holometabolous Insects
Aydemir M. N., Aydemir H. B., Durel Avcıoğlu B. S., Budak M., Başıbüyük H. H., Korkmaz E. M.
3rd Ecology And Evolutionary Biology Symposium, Ankara, Türkiye, 31 Temmuz - 01 Eylül 2016, ss.52, (Tam Metin Bildiri)
2016
201612. Effect Of Altitude-related Ecological Factors On Mitochondrial Nd6 And Atp8 Genes In Anatolian Cephus Pygmeus (cephidae, Hymenoptera) Populations
Durel Avcıoğlu B. S., Aydemir M. N., Aydemir H. B., Başıbüyük H. H., Korkmaz E. M., Budak M.
3rd Ecology And Evolutionary Biology Symposium, Ankara, Türkiye, 31 Temmuz - 01 Eylül 2016, ss.51, (Tam Metin Bildiri)
2015
201513. Putative Function Of Mitochondrial Tandem Repeat Sequences In Stem Borers (cephidae: Hymenoptera)
Korkmaz E. M., Aydemir M. N., Durel Avcıoğlu B. S., Sari M., Başıbüyük H. H.
Ecology And Evolutionary Biology Symposium, Ankara, Türkiye, 6 - 07 Ağustos 2015, ss.17, (Tam Metin Bildiri)
2014
201414. Mitokondri Genomunda Saklı Yaplar: Hymenoptera (insecta) Örneği
BAŞIBÜYÜK H. H., AYDEMİR M. N., KORKMAZ E. M., BUDAK M.
2. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, Türkiye, 23 - 27 Haziran 2014, ss.1, (Tam Metin Bildiri)
2014
201415. Mitokondri Genomunda Sakl Yaplar: Hymenoptera (insecta) Örnegi
Başıbüyük H. H., Aydemir M. N., Korkmaz E. M., Budak M.
22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, Türkiye, 23 - 27 Haziran 2014, ss.1, (Tam Metin Bildiri)
2014
201416. Trachelus Iudaicus (hymenoptera: Cephidae) Türü Mitogenomunun Karakterizasyonu
Aydemir M. N., Korkmaz E. M., Budak M., Başıbüyük H. H.
22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, Türkiye, 23 - 27 Haziran 2014, ss.1, (Tam Metin Bildiri)
Kitaplar
2024
20241. Exploring the Role of Mitochondrial DNA Mutations in Cancer Development and Diagnosis
Yıldırımtepe Çaldıran F., Aydemir M. N.
Interdisciplinary Cancer Research, Rezaei Nima, Editör, Springer, London/Berlin , Basel, ss.1-28, 2024
Desteklenen Projeler
2025 - 2028
2025 - 2028Türkiye Göllerinde Su Kalitesinin İzlenmesi: Sucul Omurgasızların Gen İfadeleri ve Makine Öğrenmesi Uygulamaları
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Aydemir H. B.(Yürütücü), Aydemir M. N., Berkel Ç., Mercan D., Arslan N.
2024 - 2027
2024 - 2027Ay Denizanası Aurelia aurita (Linnaeus, 1758)’ nın Peyzaj Genetiği Çalışması: İzmit Körfezi’ ndeki Kirlilik Gradiyenti Örneklemi
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
(Proje Özeti)
AYDEMİR M. N. (Yürütücü), İŞİNİBİLİR OKYAR M., AYDEMİR H. B., BERKEL Ç.
2025 - 2026
2025 - 2026Türkiye’de Ekolojik ve Ekonomik Öneme Sahip Üç Farklı Balık Türünün (Belone belone, Trachurus mediterraneus,Trigla lyra) Mitogenom Karakterizasyonu
TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı
Aydemir M. N. (Yürütücü), Yıldız T., Aydemir H. B., Cömert N.
2025 - 2026
2025 - 2026Müsilaja Karşı Genetik Savunma: Deniz Hıyarlarında Biyoinformatik Tabanlı Sindirim Enzimi Analizi
TÜBİTAK Projesi , 2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı
Aydemir M. N., Ceylan Y.(Yürütücü)
2025 - 2026
2025 - 2026Ay Denizanasında Peyzaj Genetiği Çalışmalarında Kullanılabilecek Olası Bir Biyobelirteç: mtDNAcn
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
(Proje Özeti)
İşinibilir Okyar M. (Yürütücü), Aydemir M. N., Çalıcı S. Z.
2024 - 2025
2024 - 2025
Denizanası Aurelia aurita'da farklı DNA ekstraksiyon yöntemlerinin etkinliklerinin sınanması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
(Proje Özeti)
Aydemir M. N. (Yürütücü), Bayrak B., Avşaroğlu Z. A., Yavuz H. B., Kelel N.
2022 - 2024
2022 - 2024
Mitotranskriptomun over kanserinde kemodirenç gelişimi üzerindeki potansiyel etkilerinin araştırılması
TÜBİTAK Projesi , 2218 - Yurt İçi Doktora Sonrası Araştırma Burs Programı
(Proje Özeti)
Aydemir M. N. (Yürütücü), Çaçan E.
2018 - 2021
2018 - 2021Pancrustacea Mitogenomunda Korunmus "whwghtw" Motifinin Mitokondriyal Transkripsiyondaki Olası Rolünün Arastırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora
Korkmaz E. M.(Yürütücü), Aydemir M. N.
2018 - 2021
2018 - 2021Ecdysozoa Üstsubesi İçin Yeni Bir Moleküler Sinapomorfi: Olası Bir Mitogenomik Transkripsiyon Sinyal Dizisinin Deneysel Olarak Arastırılması" Adlı 117Z020 Numaralı Tübitak Projesi Kapsamında Bilim Insanı Yetistirme Ve Gelistirme Projesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , Üniversite Destekli Diğer Projeler
Korkmaz E. M.(Yürütücü), Budak M., Aydemir H. B., Aydemir M. N.
2017 - 2020
2017 - 2020Ecdysozoa Üstsubesi Için Yeni Bir Moleküler Sinapomorfi: Olası Bir Mitogenomik Transkripsiyon Sinyal Dizisinin Deneysel Olarak Arastırılması
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
(Proje Özeti)
Korkmaz E. M.(Yürütücü), Budak M., Başıbüyük H. H., Bağda E., Pınarbaşı E.
2015 - 2017
2015 - 2017Hymenoptera Mitoproteomigi: Polinatör Bombus Terrestris (hymenoptera: Apidae) Türünde Olası Bir Transkripsiyon Terminasyon Sinyalinin Arastırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
Korkmaz E. M.(Yürütücü), Budak M., Başıbüyük H. H., Aydemir H. B., Aydemir M. N.
2013 - 2015
2013 - 2015Diprion Pini (hymenoptera: Diprionidae) Türünün Total Mitokondri Genomu Üzerine Arastırmalar
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
Korkmaz E. M.(Yürütücü), Aydemir M. N.
2012 - 2015
2012 - 2015Bazal Hymenoptera (Insecta) Familyalarında Mitokondri Genomunun Evrimi: Hymenoptera Filogenisinin Yeniden Yapılandırılması
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Korkmaz E. M.(Yürütücü), Başıbüyük H. H., Sari M., Hastaoğlu Örgen S.
Etkinlik Organizasyonlarındaki Görevler
Eylül 2024
Eylül 20243rd International Aquatic Biotechnology Symposium
Bilimsel Kongre / Sempozyum Organizasyonu
Memiş D., Tunçelli G., Deniz G., Albay M., İşinibilir Okyar M., Altuğ G., et al.
İstanbul, Türkiye
Ödüller
Eylül 2025
Eylül 2025
Biyoteknoloji ve İnovasyon Yarışması Üniversite ve Üzeri Seviyesi Fikir Kategorisi Finalisti
Teknofest 2025