Prof. Dr. MAHMUT ÇALIŞKAN


Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü

Biyoteknoloji Anabilim Dalı


WoS Araştırma Alanları: Biyoloji, Biyoteknoloji Ve Uygulamalı Mikrobiyoloji


Scopus Araştırma Alanları: Biyoteknoloji


Avesis Araştırma Alanları: Biyoteknoloji


Yayınlardaki İsimler: mahmut caliskan

E-posta: mahmut.caliskan@istanbul.edu.tr
İş Telefonu: +90 212 455 5700 Dahili: 20312
Fax Telefonu: +90 212 522 6562
Web: http://aves.istanbul.edu.tr/mahmut.caliskan/
Ofis: Biyoteknoloji Anabilim Dalı Tel: 20312
Posta Adresi: İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü Biyoteknoloji Anabilim Dalı Vezneciler-İSTANBUL

Metrikler

Yayın

89

Yayın (WoS)

36

Yayın (Scopus)

34

Atıf (WoS)

552

H-İndeks (WoS)

13

Atıf (Scopus)

640

H-İndeks (Scopus)

13

Atıf (Scholar)

3036

H-İndeks (Scholar)

29

Proje

36

Tez Danışmanlığı

18
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

Biyografi

Ankara Yenişehir Sağlık Koleji mezunudur. Mezuniyet sonrası Ankara Numune Hastanesi ve Ankara Trafik Hastanesinde bilgisayarlı beyin tomografisi biriminde görev yapmıştır. Lisans eğitimini ODTÜ Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümünde tamamlamıştır. Akademik çalışma hayatına ODTÜ’de Araştırma Görevlisi olarak başlamıştır. YÖK Yurtdışı Öğretim Üyesi Yetiştirme Programı bursunu kazanarak İngiltere Leeds Üniversitesi Genetik Departmanında doktora çalışmalarına başlamış ve aynı birimden Dr. ünvanı ile mezun olmuştur. Leeds Üniversitesi Genetik Bölümünde bir süre lisans ve yüksek lisans öğrencilerinin yetişmesi için Post-Doc olarak bulunmuştur. Türkiye’ye dönünce Mustafa Kemal Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Moleküler Biyoloji Anabilim dalında Yard. Doç. Dr. olarak çalışmaya başlamıştır. Aynı birimde 2001 yılında Doçent kadrosuna, 2006 yılında Profesör kadrosuna atanmıştır. MKÜ Fen-Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü Moleküler Biyoloji laboratuarını oluşturmuş ve buradan lisans ve yüksek lisans çalışmalarının yapılmasına olanak sağlamıştır. 2014 yılında İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümüne Profesör olarak atanmıştır. 2015-2021 yılları arasında İstanbul Üniversitesi Biyoloji Bölüm Başkanı ve 2018-2024 yılları arasında İstanbul Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Müdürü olarak görev yapmıştır. Bölüm Başkanlığı sırasında Biyoloji Bölümünde Biyoteknoloji Anabilim Dalı ile Çevre Biyolojisi ve Ekolojisi Anabilim Dallarının kurulmasını sağlamıştır. Biyoteknoloji anabilim dalının kurucu başkanı olarak biyoteknoloji anabilim dalında çalışmalarına devam etmektedir.

Eğitim Bilgileri

1997 - 1998

1997 - 1998

Post Doktora

University of Leeds, Department Of Genetics, Genetik, Birleşik Krallık

1993 - 1997

1993 - 1997

Doktora

University of Leeds, Department Of Genetics, Genetik, Birleşik Krallık

1987 - 1992

1987 - 1992

Lisans

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye

Yabancı Diller

C1 İleri

C1 İleri

İngilizce

Araştırma Alanları

Avesis Araştırma Alanları: Biyoteknoloji
WoS Araştırma Alanları: Biyoloji, Biyoteknoloji Ve Uygulamalı Mikrobiyoloji
Scopus Araştırma Alanları: Biyoteknoloji

Akademik Faaliyetlere Dayalı Araştırma Alanları

Avesis Araştırma Alanları

    WoS Araştırma Alanları

      Scopus Araştırma Alanları

        Akademik Ünvanlar / Görevler

        2014 - Devam Ediyor

        2014 - Devam Ediyor

        Prof. Dr.

        İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü

        2006 - 2014

        2006 - 2014

        Prof. Dr.

        Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji

        2000 - 2005

        2000 - 2005

        Doç. Dr.

        Mustafa Kemal Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji

        1997 - 2000

        1997 - 2000

        Yrd. Doç. Dr.

        Mustafa Kemal Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji

        1993 - 1997

        1993 - 1997

        Araştırma Görevlisi

        The University of Leeds, Faculty Of Scıences, Deparment Of Genetıcs

        1992 - 1993

        1992 - 1993

        Araştırma Görevlisi

        Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji

        Yönetimsel Görevler

        2019 - Devam Ediyor

        2019 - Devam Ediyor

        Anabilim/Bilim Dalı Başkanı

        İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoteknoloji

        2018 - 2024

        2018 - 2024

        Enstitü Müdürü

        İstanbul Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü

        2016 - 2021

        2016 - 2021

        Fakülte Yönetim Kurulu Üyesi

        İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü

        2015 - 2021

        2015 - 2021

        Bölüm Başkanı

        İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü

        2015 - 2021

        2015 - 2021

        Fakülte Kurulu Üyesi

        İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü

        1998 - 2014

        1998 - 2014

        Anabilim/Bilim Dalı Başkanı

        Mustafa Kemal Üniversitesi

        2006 - 2009

        2006 - 2009

        Senato Üyesi

        Mustafa Kemal Üniversitesi

        2000 - 2006

        2000 - 2006

        Akademik Kurul Üyesi

        Mustafa Kemal Üniversitesi

        1999 - 2002

        1999 - 2002

        Dekan Yardımcısı

        Mustafa Kemal Üniversitesi

        Akademi Dışı Deneyim

        1986 - 1992

        1986 - 1992

        Radyoloji Teknisyeni

        ANKARA NUMUNE EĞİTİM VE ARAŞTIRMA HASTANESİ, Radyoloji Teknisyeni

        Verdiği Dersler

        Yüksek Lisans

        Yüksek Lisans

        Bilimsel Araştırma Teknikleri ve yayın Etiği

        Lisans

        Lisans

        Biyoteknoloji Uygulamaları

        Mesleki İngilizce

        Gen Manipülasyonu

        Yaşam II: Hücrelerden Organizmalara

        Yaşam I: Moleküllerden Hücrelere

        Genetics

        Yönetilen Tezler

        2025

        2025

        Yüksek Lisans

        TÜP BEBEK TEDAVİSİNDE KULLANILAN MOLEKÜLER TEKNİKLER

        Çalışkan M. (Danışman)

        R.MASALATI(Öğrenci)

        2004

        2004

        Yüksek Lisans

        Oksalik asit'in buğday emriyo gelişimine etkisi

        Çalışkan M. (Danışman)

        M.GÖK(Öğrenci)

        Tasarlanan Programlar

        2021 - Devam Ediyor

        2021 - Devam Ediyor

        Biyoteknoloji Doktora Programı

        Doktora

        Çalışkan M.

        2019 - Devam Ediyor

        2019 - Devam Ediyor

        Biyoteknoloji Tezli Yüksek Lisans Programı

        Yüksek Lisans

        Çalışkan M.

        Makaleler

        Tümü (51)
        SCI-E, SSCI, AHCI (36)
        SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (36)
        Scopus (34)
        TRDizin (10)
        Diğer Yayınlar (4)

        2000

        2000

        49. The Metabolism of Oxalic acid

        Çalışkan M.

        Turkish Journal Of Biology , cilt.24, ss.103-106, 2000 (Hakemli Dergi)

        Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler

        2025

        2025

        1. MetaPepticon: automated anticancer peptide prediction from genomics and metagenomics datasets

        Erözden A. A., Tavşanli N., Demirel G., Şanli N. Ö., Çalişkan M., Arikan M.

        EMBO | EMBL Symposium: The Human Microbiome, Heidelberg, Almanya, 16 - 19 Eylül 2025, (Yayınlanmadı)

        2024

        2024

        2. MetaPepticon: An Automated Pipeline for Anticancer Peptide Prediction from Shotgun Metagenomics Datasets

        Erözden A. A., Tavşanlı N., Demirel G., Şanlı N. Ö., Çalışkan M., Arıkan M.

        The 17th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, İstanbul, Türkiye, 18 - 20 Aralık 2024, ss.31, (Özet Bildiri)

        2017

        2017

        3. Bitkilerin Klasik Türk Şiirine Yansımaları

        GERÇEK Y. C., MORGİL H., EROL Ç., ÇİFTÇİ A., ŞIK L., ÇALIŞKAN M., et al.

        International and Interdisciplinary Environment and Literature Symposium, 1 - 03 Ekim 2017, (Özet Bildiri)

        2017

        2017

        4. Phytoremediation: Remove of Toxic Metals from the Environment Using Plants

        GERÇEK Y. C., MORGİL H., EROL O., ÇİFTÇİ A., ŞIK L., EROL Ç., et al.

        International and Interdisciplinary Environment and Literature Symposium, 1 - 03 Ekim 2017, (Özet Bildiri)

        2017

        2017

        6. Salinity Impact On Fatty Acid Composition of Coriandrum Sativum L. Leaves

        GERÇEK Y. C., MORGİL H., ECEM BAYRAM N., ÇALIŞKAN M., ÖZ G.

        The Second Japan – Turkey International Symposium on Pharmaceutical and Biomedical Sciences, Trabzon, Türkiye, 11 - 12 Eylül 2017, ss.85, (Özet Bildiri)

        2017

        2017

        8. Fatty Acid Composition of Chlorella vulgaris Byheterotrophic Growth In Fermenters

        GERÇEK Y. C., Ünlü Y. S., MORGİL H., ECEM BAYRAM N., ÇALIŞKAN M., ÖZ G.

        The Second Japan – Turkey International Symposium on Pharmaceutical and Biomedical Sciences, Trabzon, Türkiye, 11 - 12 Eylül 2017, ss.84, (Özet Bildiri)

        2017

        2017

        9. Determining The Germin Gene Expression in Auxin Induced Wheat Coleoptile Growth

        Alanei Y., MORGİL H., GERÇEK Y. C., ÇALIŞKAN M., ÖZ G.

        II. International Conference on Advanced Engineering Technologies, 21 - 23 Eylül 2017, (Özet Bildiri)

        2017

        2017

        10. Phytoremediation: Remove of Toxic Metals from the Environment Using Plants.

        GERÇEK Y. C., MORGİL H., EROL O., ÇİFTÇİ A., ŞIK L., EROL Ç., et al.

        International and Interdisciplinary Environment and Literature Symposium, 2017, 5 - 08 Ağustos 2017, (Özet Bildiri)

        2017

        2017

        11. FATTY ACID COMPOSITION OF CHLORELLA VULGARIS GROWN IN OPEN POND

        GERÇEK Y. C., Ünlü Y. S., Sarayloo E., Şimşek S., MORGİL H., ÇALIŞKAN M., et al.

        I. INTERNATIONAL CONGRESS on MEDICINAL and AROMATICPLANTS: “NATURAL and HEALTHY LIFE”, 10 - 12 Nisan 2017, (Özet Bildiri)

        2017

        2017

        12. Oil content and fatty acid composition of Turkishhazelnuts (Corylus avellana L.)

        GERÇEK Y. C., MORGİL H., ÇALIŞKAN M., ÖZ G.

        The Third International MediterraneanSymposium onMedicinal and Aromatic Plants, 13 - 16 Nisan 2017, (Özet Bildiri)

        2015

        2015

        13. Thuja orientalis L. Bitkisinin Uçucu Yağ İçeriklerinin GC-MS ile Belirlenmesi

        ÖZ G., ÇALIŞKAN M., GERÇEK Y. C., Tuğcu T.

        2. Ulusal botanik Kongresi, Afyon, Türkiye, 25 - 28 Ağustos 2015, cilt.1, sa.1, ss.64, (Tam Metin Bildiri)

        2014

        2014

        14. Ticari Mısır Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Ürünlerin Belirlenmesi

        ÖZ G., Morgil H., Ünlü Y. S., Barış D. İ., ÇALIŞKAN M.

        Ulusal Botanik Kongresi, İstanbul, Türkiye, 25 - 28 Ekim 2014, ss.19, (Tam Metin Bildiri)

        Kitaplar

        2026

        2026

        2. Biotechnological Applications of Archaea

        TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A., ARIKAN M., ÇALIŞKAN M.

        Microbial World: Bacteria and Archaea, ÇALIŞKAN MAHMUT, ARIKAN MUZAFFER, Editör, Springer Nature Switzerland, İstanbul, ss.191-216, 2026

        2026

        2026

        3. Microbial Omics

        Erözden A. A., Tavşanlı N., Çalışkan M., Arıkan M.

        Microbial World: Bacteria and Archaea, ÇALIŞKAN MAHMUT,ARIKAN MUZAFFER, Editör, Springer, Cham, London, ss.333-366, 2026

        2023

        2023

        5. Hücrelerin Dokulara Dönüşmesi

        Çalışkan M.

        Moleküler Hücre Biyolojisi, Murat Özmen,Hikmet Geçkil,Özfer yeşilada, Editör, Palme Yayın Dağıtım, Ankara, ss.1-1184, 2023

        2023

        2023

        6. Evrim Modelleri

        Çalışkan M.

        Evrim, Ergi Deniz Özsoy, Editör, Palme Yayın Dağıtım, Ankara, ss.1-656, 2023

        2023

        2023

        7. “Omics” Technologies in Biodegradation Processes

        Aydın S., Çalışkan M.

        Marine Organisms: A Solution to Environmental Pollution?. Environmental Challenges and Solutions, Encarnação,T.,Canelas Pais,A., Editör, Springer, London/Berlin , Zürich, ss.1-269, 2023 Sürdürülebilir Kalkınma

        2023

        2023

        8. The Diversity of Gut Bacteria and Psychological Disorders

        Aydın S., Tavşanlı N., Erözden A. A., Çalışkan M.

        Genetic Diversity - Recent Advances and Applications, Prof. Dr. Mahmut Çalışkan, Editör, Intech Open, London, ss.1-20, 2023 Sürdürülebilir Kalkınma

        2017

        2017

        13. Carbohydrate

        ÇALIŞKAN M., Kavaklı İ. H., ÖZ G.

        Intech Publication, Rijeka, 2017

        2017

        2017

        14. Carbohydrate

        ÇALIŞKAN M., KAVAKLI İ. H., ÖZ G.

        InTech Publication, 2017

        2016

        2016

        15. Genetik Mühendisliği ve Biyoteknoloji

        ÇALIŞKAN M.

        Brock Mikroorganizmaların Biyolojisi, Prof. Dr. Cumhur Çökmüş, Editör, Palme Yayın Dağıtım, Ankara, ss.315-346, 2016

        2016

        2016

        16. Bacteria ve Archaea Genetiği

        ÇALIŞKAN M.

        Brock Mikroorganizmaların Biyolojisi, Prof. Dr. Cumhur Çökmüş, Editör, Palme Yayın Dağıtım, Ankara, ss.291-314, 2016

        2012

        2012

        18. Genetic Diversity in Plants

        ÇALIŞKAN M.

        InTech Publishing, 2012

        2012

        2012

        21. Genetic Variation in Animals

        ÇALIŞKAN M.

        InTech Publishing, 2012

        2011

        2011

        22. Abiotic Stress Response in Plants - Physiological, Biochemical and Genetic Perspectives

        Çalışkan M.

        Abiotic Stress Response in Plants - Physiological, Biochemical and Genetic Perspectives, Arun Shanker,B. Venkateswarlu, Editör, IntechOpen, London, ss.297-320, 2011

        2011

        2011

        23. Hücrelerin Dokulara Dönüşmesi

        ÇALIŞKAN M.

        Moleküler Hücre Biyolojisi, Geçkil H, Özmen M, Yeşilada Ö, Editör, Wh Bedford, Freeman & Worth Publishing Group, Ankara, ss.801-846, 2011

        2008

        2008

        24. Evrim Modelleri

        ÇALIŞKAN M.

        Evrim, Kence A, Bozcuk AN, Editör, Sinauer Associates, Inc. , Ankara, ss.43-65, 2008

        Desteklenen Projeler

        2026 - Devam Ediyor

        2026 - Devam Ediyor

        Fisetin/DOX Yüklü HA/RGD Fonksiyonelleştirilmiş Nanoparçacıkların 3B Sferoid Modellerinde Hedeflenmesi

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora

        ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), ÇAKIL DÖNMEZ Y., DEMİREL G.

        2025 - Devam Ediyor

        2025 - Devam Ediyor

        Farklı Model Organizmalarda Kanser Çoklu Omik Verilerinin Analizleri İçin Yeni Biyoinformatik Araçların GeliştirilmesiSürdürülebilir Kalkınma

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora

        ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), ERÖZDEN A. A.

        2023 - 2025

        2023 - 2025

        BMAL1in bHLH ve PASA bölgelerinde yer alan patojenik SNPlerinin BMAL1 fonksiyonuna etkilerinin incelenmesi

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans

        ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), İZGİŞ H., GÜL Ş.

        2022 - 2025

        2022 - 2025

        İlaç yeniden konumlandırma metoduyla biyogüvenli SARS-CoV-2 replikonu kullanılarak SARS-CoV-2 inhibitörü bulunmasıSürdürülebilir Kalkınma

        TÜBİTAK Projesi , 3501 - Ulusal Genç Araştırmacı Kariyer Geliştirme Programı

        Gül Ş. (Yürütücü), Topçul M. R., Çetin İ., Çalışkan M., Okyar A.

        2022 - 2024

        2022 - 2024

        Kriptokrom1 ikincil pakete bağlanan moleküllerin sirkadiyen saat üzerine olan etkilerinin incelenmesi

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

        ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), KAVAKLI İ. H., GÜL Ş., KAVAKLI H.

        2022 - 2024

        2022 - 2024

        Patojenik BMAL1 SNP'lerinin Sirkadiyen Saat Mekanizmasına Etksinin Belirlenmesi

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

        ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), KAVAKLI İ. H., GÜL Ş.

        2022 - 2024

        2022 - 2024

        Green All Together

        Erasmus Projesi , Erasmus+ KA2 Yenilik ve İyi Uygulamaların Değişimi için İşbirliği Projesi, Ulusal Düzey

        Aydın S. (Yürütücü), Çalışkan M., Tavşanlı N., Erözden A. A.

        2019 - 2020

        2019 - 2020

        Gliotoksin'in Farklı Meme Kanseri Hücre Hatlarındaki Kinetik Etkilerinin DeğerlendirilmesiSürdürülebilir Kalkınma

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans

        ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), AKKÜLAH ŞENOL G.

        2019 - 2019

        2019 - 2019

        Carbohydrate

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

        ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), KAVAKLI H., ÖZ G.

        2017 - 2017

        2017 - 2017

        Molecular Approaches to Genetic Diversity

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

        ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), ÖZ G., ÖZCAN B., KAVAKLI İ. H.

        2005 - 2008

        2005 - 2008

        Mercimekte (Lens culinaris Medic.) nişaşta sentezinde görev alan cDNA genlerinin izolasyonu ve karakterizasyonu

        TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

        Kavaklı İ. H.(Yürütücü), Çalışkan M.

        Bilimsel Dergilerdeki Faaliyetler

        2015 - Devam Ediyor

        2015 - Devam Ediyor

        European Journal of Biology

        Editörler Kurulu Üyesi

        Bilimsel Yayınlarda Hakemlikler

        Mayıs 2015

        Mayıs 2015

        European Journal of Biology

        Diğer Dergiler

        Ödüller

        Haziran 2013

        Haziran 2013

        2012 Yılı Bilimsel Yayın Ödülü

        Mustafa Kemal Üniversitesi

        Temmuz 2012

        Temmuz 2012

        Kitap Çeviri Mansiyon Ödülü

        Tüba

        Temmuz 2011

        Temmuz 2011

        Kitap Çeviri Eser Ödülü

        Tüba

        Temmuz 2008

        Temmuz 2008

        Kitap Çeviri Eser Ödülü

        Tüba

        Haziran 2002

        Haziran 2002

        Yurt dısı arastırma destegi

        Hatay Mustafa Kemal Ünıversıtesı,

        Haziran 1999

        Haziran 1999

        Yurd Dışı Bilimsel Toplantı Katılma Desteği

        Tübitak

        

        Burslar

        2004 - 2004

        2004 - 2004

        NATO B2 Yurt Dışı Doktora Sonrası Araştırma Bursu

        TÜBİTAK

        1993 - 1998

        1993 - 1998

        Yurt Dışı Doktora Bursu

        YÖK

        Atıflar

        Toplam Atıf Sayısı (WOS): 538

        h-indeksi (WOS): 13

        Jüri Üyelikleri

        Haziran-2008

        Haziran 2008

        Tez Savunma (Doktora)

        - Çeşitli Üniversiteler

        Haziran-2007

        Haziran 2007

        Doçentlik Sınavı

        - Çeşitli Üniversiteler

        Haziran-2001

        Haziran 2001

        Akademik Kadroya Atama-Yardımcı Doçentlik

        - Çeşitli Üniversiteler

        Haziran-2000

        Haziran 2000

        Tez Savunma (Yüksek Lisans)

        - Mustafa Kemal Üniversitesi