Biyografi
Ankara Yenişehir Sağlık Koleji mezunudur. Mezuniyet sonrası Ankara Numune Hastanesi ve Ankara
Trafik Hastanesinde bilgisayarlı beyin tomografisi biriminde görev yapmıştır. Lisans eğitimini ODTÜ Fen Edebiyat Fakültesi
Biyoloji Bölümünde tamamlamıştır. Akademik çalışma hayatına ODTÜ’de Araştırma
Görevlisi olarak başlamıştır. YÖK Yurtdışı Öğretim Üyesi Yetiştirme Programı bursunu
kazanarak İngiltere Leeds Üniversitesi Genetik Departmanında doktora
çalışmalarına başlamış ve aynı birimden Dr. ünvanı ile mezun olmuştur. Leeds Üniversitesi
Genetik Bölümünde bir süre lisans ve yüksek lisans öğrencilerinin yetişmesi
için Post-Doc olarak bulunmuştur. Türkiye’ye dönünce Mustafa Kemal Üniversitesi
Fen Edebiyat Fakültesi Moleküler Biyoloji Anabilim dalında Yard. Doç. Dr. olarak
çalışmaya başlamıştır. Aynı birimde 2001 yılında Doçent kadrosuna, 2006 yılında
Profesör kadrosuna atanmıştır. MKÜ Fen-Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü
Moleküler Biyoloji laboratuarını oluşturmuş ve buradan lisans ve yüksek lisans
çalışmalarının yapılmasına olanak sağlamıştır. 2014 yılında İstanbul
Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümüne Profesör olarak atanmıştır. 2015-2021
yılları arasında İstanbul Üniversitesi Biyoloji Bölüm Başkanı ve 2018-2024
yılları arasında İstanbul Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Müdürü olarak
görev yapmıştır. Bölüm Başkanlığı sırasında Biyoloji Bölümünde Biyoteknoloji
Anabilim Dalı ile Çevre Biyolojisi ve Ekolojisi Anabilim Dallarının kurulmasını
sağlamıştır. Biyoteknoloji anabilim dalının kurucu başkanı olarak biyoteknoloji
anabilim dalında çalışmalarına devam etmektedir.
Eğitim Bilgileri
1997 - 1998
1997 - 1998Post Doktora
University of Leeds, Department Of Genetics, Genetik, Birleşik Krallık
1993 - 1997
1993 - 1997Doktora
University of Leeds, Department Of Genetics, Genetik, Birleşik Krallık
1987 - 1992
1987 - 1992Lisans
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye
Yabancı Diller
C1 İleri
C1 İleriİngilizce
Araştırma Alanları
Akademik Faaliyetlere Dayalı Araştırma Alanları
Avesis Araştırma Alanları
WoS Araştırma Alanları
Scopus Araştırma Alanları
Akademik Ünvanlar / Görevler
2014 - Devam Ediyor
2014 - Devam EdiyorProf. Dr.
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü
2006 - 2014
2006 - 2014Prof. Dr.
Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji
2000 - 2005
2000 - 2005Doç. Dr.
Mustafa Kemal Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji
1997 - 2000
1997 - 2000Yrd. Doç. Dr.
Mustafa Kemal Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji
1993 - 1997
1993 - 1997Araştırma Görevlisi
The University of Leeds, Faculty Of Scıences, Deparment Of Genetıcs
1992 - 1993
1992 - 1993Araştırma Görevlisi
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji
Yönetimsel Görevler
2019 - Devam Ediyor
2019 - Devam EdiyorAnabilim/Bilim Dalı Başkanı
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoteknoloji
2018 - 2024
2018 - 2024Enstitü Müdürü
İstanbul Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü
2016 - 2021
2016 - 2021Fakülte Yönetim Kurulu Üyesi
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü
2015 - 2021
2015 - 2021Bölüm Başkanı
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü
2015 - 2021
2015 - 2021Fakülte Kurulu Üyesi
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü
1998 - 2014
1998 - 2014Anabilim/Bilim Dalı Başkanı
Mustafa Kemal Üniversitesi
2006 - 2009
2006 - 2009Senato Üyesi
Mustafa Kemal Üniversitesi
2000 - 2006
2000 - 2006Akademik Kurul Üyesi
Mustafa Kemal Üniversitesi
1999 - 2002
1999 - 2002Dekan Yardımcısı
Mustafa Kemal Üniversitesi
Akademi Dışı Deneyim
1986 - 1992
1986 - 1992Radyoloji Teknisyeni
ANKARA NUMUNE EĞİTİM VE ARAŞTIRMA HASTANESİ, Radyoloji Teknisyeni
Yönetilen Tezler
2025
2025Yüksek Lisans
BMAL1'İN PAS-B ALANI ve C-UCU OSİLASYON REGÜLATÖR BÖLGELERİNDE YER ALAN PATOJENİK SNP'LERİNİN BMAL1 FONKSİYONUNA ETKİLERİNİN İNCELENMESİ
Çalışkan M. (Danışman)
S.AYDOĞAN(Öğrenci)
2025
2025Yüksek Lisans
Hücresel Düzeyde Sirkadiyen Ritmin Periyod Uzunluğunu Değiştiren Moleküllerin Karakterizasyonu
Çalışkan M. (Danışman)
E.TORAMAN(Öğrenci)
2025
2025Yüksek Lisans
BMAL1'İN BHLH VE PAS-A BÖLGELERİNDE YER ALAN PATOJENİK SNP'LERİNİN BMAL1 FONKSİYONUNA ETKİLERİNİN İNCELENMESİ
Çalışkan M. (Danışman)
H.İZGİŞ(Öğrenci)
2025
2025Yüksek Lisans
TÜP BEBEK TEDAVİSİNDE KULLANILAN MOLEKÜLER TEKNİKLER
Çalışkan M. (Danışman)
R.MASALATI(Öğrenci)
2025
2025Yüksek Lisans
AZD 0156 VE ABRAXANE KOMBİNASYONUNUN İNSAN MEME KANSERİ HÜCRE HATLARI ÜZERİNE ETKİLERİ
Çalışkan M. (Danışman)
F.ZENDEL(Öğrenci)
2024
2024Yüksek Lisans
İlaç yeniden konumlandırma yaklaşımıyla SARS-CoV-2 virüsüne karşı ın vitro yöntemlerle ilaç tasarımı
Çalışkan M. (Danışman)
B.ORUÇOĞLU(Öğrenci)
2023
2023Yüksek Lisans
Jelatin/aljinat/hiyalüronik asit ile oluşturulan iskelede karaciğer dokusunun morfolojik özelliklerinin araştırılması
Çalışkan M. (Danışman)
G.DEMİREL(Öğrenci)
2022
2022Doktora
Embriyonik fibroblast hücrelerinde arsenikle indüklenmiş genotoksi̇k ve apoptotik mekanizmalar üzeri̇ne n-asetilsi̇steinin etkileri
Çalışkan M. (Danışman)
T.TAŞÇİ(Öğrenci)
2020
2020Yüksek Lisans
Gliotoksin'in Farklı Meme Kanseri Hücre Hatlarındaki Kinetik Etkilerinin Değerlendirilmesi
Çalışkan M., Topçul M. R. (Eş Danışman)
G.ŞENOL(Öğrenci)
2020
2020Doktora
Glycine max hücre süspansiyon ekstraktının B16-F10 melanoma hücreleri üzerinde anti-melanogenez aktivitesinin belirlenmesi
Çalışkan M. (Danışman)
Y.BODURLAR(Öğrenci)
2018
2018Yüksek Lisans
Determining the germin gene expression in auxin induced coleoptile growth
Çalışkan M. (Danışman)
Y.Fadhil(Öğrenci)
2012
2012Yüksek Lisans
İmmobilize edilmiş halofilik arkelerde lipaz, proteaz ve amilaz aktivitelerinin belirlenmesi
Çalışkan M. (Danışman)
Z.EROĞLU(Öğrenci)
2008
2008Yüksek Lisans
Verbascum pinetorum (Boiss.) O. Kuntze bitki ekstraktının antimikrobiyal ve antioksidan aktivitesinin belirlenmesi
Çalışkan M. (Danışman)
M.ESEN(Öğrenci)
2008
2008Yüksek Lisans
Çankırı Çankaya Tuz Madeni'nden halofilik arkelerin izolasyonu ve karakterizasyonu
Çalışkan M.
E.YILDIZ(Öğrenci)
2007
2007Yüksek Lisans
Orak hücre anemili hastalarda metilentetrahidrofolat redüktaz geninin C677T polimorfizminin belirlenmesi
Çalışkan M. (Danışman)
M.AYTAÇ(Öğrenci)
2004
2004Yüksek Lisans
Oksalik asit'in buğday emriyo gelişimine etkisi
Çalışkan M. (Danışman)
M.GÖK(Öğrenci)
2003
2003Yüksek Lisans
ORAK HÜCRE ANEMİSİNİN ELEKTROFORETİK TEKNİKLERLE BELİRLENMESİ
Çalışkan M. (Danışman)
M.SEZER(Öğrenci)
2001
2001Yüksek Lisans
Hedysarum pogonocarpum boiss.'un alt türleri arasındaki izoenzim varyasyonlarının araştırılması
Çalışkan M. (Danışman)
A.YAVUZ(Öğrenci)
Tasarlanan Programlar
2019 - Devam Ediyor
2019 - Devam EdiyorBiyoteknoloji Tezli Yüksek Lisans Programı
Yüksek Lisans
Çalışkan M.
Makaleler
2026
20261. MetaPepticon: automated prediction of anticancer peptides from microbial genomes and metagenomes.
Erözden A. A., Tavşanli N., Demirel G., Şanli N. Ö., Çalişkan M., Arikan M.
PeerJ
, cilt.14, 2026 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20252. Identification of potential SARS-CoV-2 inhibitors among well-tolerated drugs using drug repurposing and in vitro approaches
Oruçoğlu B., Çetin İ., Şimşek H., Topçul M. R., Çalışkan M., Aydın C., et al.
SCIENTIFIC REPORTS
, cilt.15, sa.1, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20253. Comparison of the effects of crizotinib as monotherapy and as combination therapy with butyric acid on different breast cancer cells
TOPÇUL M. R., ÇETİN İ., Pulat E., ÇALIŞKAN M.
ONCOLOGY LETTERS
, cilt.29, sa.1, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20244. Evaluation of small-molecule modulators of the circadian clock: promising therapeutic approach to cancer
TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A., ÇALIŞKAN M.
MOLECULAR BIOLOGY REPORTS
, sa.1, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20245. Advances in bioinformatic approaches to tardigrade phylogeny
ERÖZDEN A. A., TAVŞANLI N., ÇALIŞKAN M.
COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY
, cilt.113, 2024 (SCI-Expanded)
2024
20246. The use of hyaluronic acid in a 3D biomimetic scaffold supports spheroid formation and the culture of cancer stem cells
Demirel G., Cakıl Y. D., Koltuk G., Aktas R. G., ÇALIŞKAN M.
Scientific Reports
, cilt.14, sa.1, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20247. Evaluating the potential effect of microalgae on soymilk vegan kefir in terms of physical, chemical, microbiological properties
Tavşanlı N., Yıldız S., Çalışkan M., Aydin S.
ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS
, cilt.82, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20248. N-acetylcysteine attenuates sodium arsenite-induced oxidative stress and apoptosis in embryonic fibroblast cells
Taşçi T., Orta Yılmaz B., Aydın Y., Çalışkan M.
TOXICOLOGY RESEARCH
, cilt.13, sa.4, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
20239. Evaluation of kinetic effects of Gliotoxin in different breast cancer cell lines
Senol G. A., ÇALIŞKAN M., TOPÇUL M. R.
CELLULAR AND MOLECULAR BIOLOGY
, sa.14, ss.76-80, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202210. Anthocyanin Addition to Kefir: Metagenomic Analysis of Microbial Community Structure.
Aydin S., Erözden A. A., Tavşanlı N., Müdüroğlu A., Çalışkan M., Kara İ.
Current microbiology
, cilt.79, sa.11, ss.327, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202211. Bacteriophage cocktail as a promising bio-enhancer for methanogenic activities in anaerobic membrane bioreactors
Aydın S., Can K., Çalışkan M., Balcazar J. L.
SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT
, cilt.832, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202212. Inhibitory activity of soybean (Glycine max L. Merr.) Cell Culture Extract on tyrosinase activity and melanin formation in alpha-melanocyte stimulating Hormone-Induced B16-F10 melanoma cells
Bodurlar Y., Caliskan M.
MOLECULAR BIOLOGY REPORTS
, cilt.49, sa.8, ss.7827-7836, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2017
201713. ORGANOSULFUR COMPOUNDS OF ALLIUM TUNCELIANUM (KOLLMANN) OZHATAY, B.MATHEW & ŞIRANECI EXTRACTS BY SPME/GC-MS AND DETERMINING THEIR CYTOTOXIC EFFECT ON HELA CELLS
GERÇEK Y. C., AKMAN G., MORGİL H., ÇALIŞKAN M., ÖZ G.
International Journal of Advances in Science Engineering and Technology
, cilt.5, sa.2, ss.53-58, 2017 (Scopus)
2017
201714. Organosulfur Compounds of Allium Tuncelianum (Kollmann) Ozhatay, B.Mathew & Şiraneci Extracts By Spme/GC-MS and Determınıng Their Cytotoxic Effect On Hela Cells
Gerçek Y. C., Akaman G., Morgil H., Çalışkan M., ÖZ G.
International Journal of Advances in Science Engineering and Technology , cilt.5, sa.2, ss.53-58, 2017 (Hakemli Dergi)
2017
201715. Investigation of the Mechanism of Physiological Tolerance in Lentil (Lens culinaris Medik.) Cultivars under Drought Stress Conditions
Morgil H., Gercek Y. C., Caliskan M., Oz G. C.
European Journal of Biology
, ss.31-35, 2017 (TRDizin)
2016
201616. Investigation of Cytotoxic Effects of Some Novel Synthesized Iminothiazolidinone Derivatives on HeLa Cell Line (CCL2)
Tuğcu F., TOPÇUL M. R., ÇETİN İ., ÜNLÜ Y. S., GERÇEK Y. C., MORGİL H., et al.
IUFS JOURNAL OF BİOLOGY
, cilt.1, sa.75, ss.15-33, 2016 (TRDizin)
2016
201617. Investigation of Genotoxic and Cytotoxic Effects of Some Novel Synthesized Iminothiazolidinone Derivatives on HeLa Cell Line CCL2
TUĞCU F. T., TOPÇUL M. R., ÇETİN İ., GERÇEK Y. C., Ünlü Y. S., MORGİL H., et al.
IUFS Journal of Biology , cilt.1, sa.75, ss.15-33, 2016 (TRDizin)
2016
201618. Glu-370 in the large subunit influences the substrate binding, allosteric, and heat stability properties of potato ADP-glucose pyrophosphorylase
Seferoglu A. B., Gul Ş., Dikbas U. M., Baris I., Koper K., Caliskan M., et al.
PLANT SCIENCE
, cilt.252, ss.125-132, 2016 (SCI-Expanded)
2016
201619. Investigation of Genotoxic and Cytotoxic Effects of Some Unique Synthesized Iminothiazolidinone Analogues on HeLa Cell Line CCL2
tuğçu f. t., TOPÇUL M. R., ÇETİN İ., MORGİL H., GERÇEK Y. C., ünlü y. s., et al.
IUFS Journal of Biology , 2016 (Hakemli Dergi)
2012
201220. Phylogenetic Analysis and Characterization of Lipolytic Activity of Halophilic Archaeal Isolates
Ozcan B., Ozyilmaz G., Cihan A., Cokmus C., Caliskan M.
MICROBIOLOGY
, cilt.81, sa.2, ss.186-194, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)
2012
201221. GENETIC DIVERSITY IN MICROORGANISMS Preface
Caliskan M.
GENETIC DIVERSITY IN MICROORGANISMS
, 2012 (SCI-Expanded)
2012
201222. Isolation, Characterization and Phylogenetic Analysis of Halophilic Archaea from a Salt Mine in Central Anatolia (Turkey)
Yildiz E., Ozcan B., Caliskan M.
POLISH JOURNAL OF MICROBIOLOGY
, cilt.61, sa.2, ss.111-117, 2012 (SCI-Expanded)
2012
201223. GENETIC DIVERSITY IN PLANTS Preface
Caliskan M.
GENETIC DIVERSITY IN PLANTS
, 2012 (SCI-Expanded)
2011
201124. Antimicrobial and antioxidant activities of the various extracts of Verbascum pinetorum Boiss. O. Kuntze (Scrophulariaceae)
Ozcan B., Esen M., Caliskan M., Mothana R. A., Cihan A. C., Yolcu H.
EUROPEAN REVIEW FOR MEDICAL AND PHARMACOLOGICAL SCIENCES
, cilt.15, sa.8, ss.900-905, 2011 (SCI-Expanded)
2011
201125. The Roles of Germin Gene Products in Plants Under Salt Stress
Caliskan M.
ABIOTIC STRESS RESPONSE IN PLANTS - PHYSIOLOGICAL, BIOCHEMICAL AND GENETIC PERSPECTIVES
, ss.297-320, 2011 (SCI-Expanded)
2010
201026. Antimicrobial and Antioxidant Activities of Various Extracts of Verbascum antiochium Boiss. (Scrophulariaceae)
Ozcan B., Yilmaz M., Caliskan M.
JOURNAL OF MEDICINAL FOOD
, cilt.13, sa.5, ss.1147-1152, 2010 (SCI-Expanded, Scopus)
2010
201027. Effective antibacterial and antioxidant properties of methanolic extract of Laurus nobilis seed oil
Ozcan B., Esen M., Sangun M. K., Coleri A., Caliskan M.
JOURNAL OF ENVIRONMENTAL BIOLOGY
, cilt.31, sa.5, ss.637-641, 2010 (SCI-Expanded, Scopus)
2010
201028. A plasma membrane H(+)ATPase gene is germination-induced in wheat embryos
ÇALIŞKAN M., Bashiardes S., Cuming A. C.
AFRICAN JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY
, cilt.9, sa.3, ss.268-272, 2010 (SCI-Expanded, Scopus)
2009
200929. Genetic variation of Atlantic horse mackerel (Trachurus trachurus) in the Turkish waters
Turan C., Ozturk B., Caliskan M., DÜZGÜNEŞ E., Gurlek M., Yaglioglu D., et al.
CAHIERS DE BIOLOGIE MARINE
, cilt.50, sa.3, ss.207-213, 2009 (SCI-Expanded)
2009
200930. Characterization of extracellular esterase and lipase activities from five halophilic archaeal strains
Ozcan B., Ozyilmaz G., Cokmus C., Caliskan M.
JOURNAL OF INDUSTRIAL MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY
, cilt.36, sa.1, ss.105-110, 2009 (SCI-Expanded, Scopus)
2009
200931. Salt stress causes a shift in the localization pattern of germin gene expression
ÇALIŞKAN M.
GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH
, cilt.8, sa.4, ss.1250-1256, 2009 (SCI-Expanded, Scopus)
2009
200932. IN VITRO ANTIMICROBIAL AND ANTIOXIDANT ACTIVITIES OF VARIOUS EXTRACTS OF Salvia microstegia (BOISS.) ET. BAL. FROM ANTAKYA, TURKEY
Ozcan B., Esen M., Coleri A., Yolcu H., Caliskan M.
FRESENIUS ENVIRONMENTAL BULLETIN
, cilt.18, ss.658-662, 2009 (SCI-Expanded)
2007
200733. Comparison of chemical composition of the essential oil of Laurus nobilis L. leaves and fruits from different regions of Hatay, Turkey
Sangun M. K., Aydin E., Timur M., Karadeniz H., Caliskan M., Ozkan A.
JOURNAL OF ENVIRONMENTAL BIOLOGY
, cilt.28, sa.4, ss.731-733, 2007 (SCI-Expanded, Scopus)
2006
200634. Characterization of extremely halophilic Archaea isolated from saline environment in different parts of Turkey
Ozcan B., Cokmus C., Coleri A., Caliskan M.
MICROBIOLOGY
, cilt.75, sa.6, ss.739-746, 2006 (SCI-Expanded, Scopus)
2006
200635. Isoenzyme variation in two allopatric populations of Hedysarum pogonocarpum Boiss. (Fabaceae), a Turkish endemic
ÇALIŞKAN M., Yavuz A., Aktoklu E.
BIOCHEMICAL SYSTEMATICS AND ECOLOGY
, cilt.34, sa.2, ss.119-126, 2006 (SCI-Expanded)
2005
200536. Phylogenetic relationships of nine mullet species (Mugilidae) in the Mediterranean Sea
Turan C., Caliskan M., Kucuktas H.
HYDROBIOLOGIA
, cilt.532, ss.45-51, 2005 (SCI-Expanded, Scopus)
2004
200437. Localization of germin genes and their products in developing wheat coleoptiles
ÇALIŞKAN M., Ozcan B., Turan C., Cuming A.
JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY
, cilt.37, sa.3, ss.339-342, 2004 (SCI-Expanded, Scopus)
2004
200438. Formation of wheat (Triticum aestivum L.) embryogenic callus involves peroxide-generating germin-like oxalate oxidase
ÇALIŞKAN M., Turet M., Cuming A.
PLANTA
, cilt.219, sa.1, ss.132-140, 2004 (SCI-Expanded, Scopus)
2004
200439. Spatial localization of germin-like oxalate oxidase genes in developing wheat shoots
Çalışkan M., Özcan B., Cuming A., Turan C.
Biotech & Biotech Equip , cilt.1, ss.10-14, 2004 (Hakemli Dergi)
2004
200440. Identification of germin isoforms in wheat callus
ÇALIŞKAN M., Turet-Sayin M., Turan C., Cuming A.
CEREAL RESEARCH COMMUNICATIONS
, cilt.32, sa.3, ss.355-361, 2004 (SCI-Expanded, Scopus)
2004
200441. Protective effect of clinoptilolite on lead toxicity in common carp Cyprinus carpio
Tepe Y., Akyurt I., Ciminli C., Mutlu E., Caliskan M.
FRESENIUS ENVIRONMENTAL BULLETIN
, cilt.13, sa.7, ss.639-642, 2004 (SCI-Expanded)
2003
200342. Isolation and localization of new germination-related sequences from wheat embryos
ÇALIŞKAN M., Bashiardes S., Ozcan B., Cuming A.
JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY
, cilt.36, sa.6, ss.580-585, 2003 (SCI-Expanded, Scopus)
2003
200343. A novel application for determination of germin gene products in situ
Çalışkan M., Cuming A., Özcan B.
Biotech & Biotech Equip , cilt.2, ss.22-26, 2003 (Hakemli Dergi)
2001
200144. Apoptosis: programlanmış hücre ölümleri
ÇALIŞKAN M.
TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY , cilt.24, ss.31-35, 2001 (TRDizin)
2001
200145. In situ localization of germin gene expression during auxin induced callus formation
ÇALIŞKAN M.
TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY , cilt.25, ss.387-396, 2001 (TRDizin)
2000
200046. Germin-like oxalate oxidase activity increase in auxin-treated wheat coleoptiles
Çalışkan M., Cuming A.
TURKISH JOURNAL OF BOTANY , cilt.24, ss.329-335, 2000 (Scopus, TRDizin)
2000
200047. Germin, an oxalate oxidase, has a function in many aspects of plant life
ÇALIŞKAN M.
TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY , cilt.24, ss.717-724, 2000 (Hakemli Dergi)
2000
200048. Temporal and spatial determination of germin biosynthesis in wheat tissues
Çalışkan M., Cuming A.
TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY , cilt.24, ss.775-782, 2000 (Hakemli Dergi)
2000
200049. The Metabolism of Oxalic acid
Çalışkan M.
Turkish Journal Of Biology , cilt.24, ss.103-106, 2000 (Hakemli Dergi)
2000
200050. Monitoring of germin synthesis by pre-absorbed anti-germin serum
Çalışkan M., Cuming A.
TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY , cilt.24, ss.271-278, 2000 (Hakemli Dergi)
1998
199851. Spatial specificity of H2O2-generating oxalate oxidase gene expression during wheat embryo germination
Caliskan M., Cuming A.
PLANT JOURNAL
, cilt.15, sa.2, ss.165-171, 1998 (SCI-Expanded, Scopus)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2025
20251. MetaPepticon: automated anticancer peptide prediction from genomics and metagenomics datasets
Erözden A. A., Tavşanli N., Demirel G., Şanli N. Ö., Çalişkan M., Arikan M.
EMBO | EMBL Symposium: The Human Microbiome, Heidelberg, Almanya, 16 - 19 Eylül 2025, (Yayınlanmadı)
2024
20242. MetaPepticon: An Automated Pipeline for Anticancer Peptide Prediction from Shotgun Metagenomics Datasets
Erözden A. A., Tavşanlı N., Demirel G., Şanlı N. Ö., Çalışkan M., Arıkan M.
The 17th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, İstanbul, Türkiye, 18 - 20 Aralık 2024, ss.31, (Özet Bildiri)
2017
20173. Bitkilerin Klasik Türk Şiirine Yansımaları
GERÇEK Y. C., MORGİL H., EROL Ç., ÇİFTÇİ A., ŞIK L., ÇALIŞKAN M., et al.
International and Interdisciplinary Environment and Literature Symposium, 1 - 03 Ekim 2017, (Özet Bildiri)
2017
20174. Phytoremediation: Remove of Toxic Metals from the Environment Using Plants
GERÇEK Y. C., MORGİL H., EROL O., ÇİFTÇİ A., ŞIK L., EROL Ç., et al.
International and Interdisciplinary Environment and Literature Symposium, 1 - 03 Ekim 2017, (Özet Bildiri)
2017
20175. Comparative Analyses of Photosynthetic Parameters and AGPase Activity of Wild Type And Transgenic Oryza Sativa L. Plants
GERÇEK Y. C., Derecik K., MORGİL H., ECEM BAYRAM N., ÇALIŞKAN M., ÖZ G.
II. International Conference on Advanced Engineering Technologies, 21 - 23 Eylül 2017, (Özet Bildiri)
2017
20176. Salinity Impact On Fatty Acid Composition of Coriandrum Sativum L. Leaves
GERÇEK Y. C., MORGİL H., ECEM BAYRAM N., ÇALIŞKAN M., ÖZ G.
The Second Japan – Turkey International Symposium on Pharmaceutical and Biomedical Sciences, Trabzon, Türkiye, 11 - 12 Eylül 2017, ss.85, (Özet Bildiri)
2017
20177. Validation of the Event-Specific Polymerase Chain Reaction Detection Methods for Genetically Modified Soy Products
GERÇEK Y. C., Mülayim B., MORGİL H., ECEM BAYRAM N., ÇALIŞKAN M., ÖZ G.
II. International Conference on Advanced Engineering Technologies, 21 - 23 Eylül 2017, (Özet Bildiri)
2017
20178. Fatty Acid Composition of Chlorella vulgaris Byheterotrophic Growth In Fermenters
GERÇEK Y. C., Ünlü Y. S., MORGİL H., ECEM BAYRAM N., ÇALIŞKAN M., ÖZ G.
The Second Japan – Turkey International Symposium on Pharmaceutical and Biomedical Sciences, Trabzon, Türkiye, 11 - 12 Eylül 2017, ss.84, (Özet Bildiri)
2017
20179. Determining The Germin Gene Expression in Auxin Induced Wheat Coleoptile Growth
Alanei Y., MORGİL H., GERÇEK Y. C., ÇALIŞKAN M., ÖZ G.
II. International Conference on Advanced Engineering Technologies, 21 - 23 Eylül 2017, (Özet Bildiri)
2017
201710. Phytoremediation: Remove of Toxic Metals from the Environment Using Plants.
GERÇEK Y. C., MORGİL H., EROL O., ÇİFTÇİ A., ŞIK L., EROL Ç., et al.
International and Interdisciplinary Environment and Literature Symposium, 2017, 5 - 08 Ağustos 2017, (Özet Bildiri)
2017
201711. FATTY ACID COMPOSITION OF CHLORELLA VULGARIS GROWN IN OPEN POND
GERÇEK Y. C., Ünlü Y. S., Sarayloo E., Şimşek S., MORGİL H., ÇALIŞKAN M., et al.
I. INTERNATIONAL CONGRESS on MEDICINAL and AROMATICPLANTS: “NATURAL and HEALTHY LIFE”, 10 - 12 Nisan 2017, (Özet Bildiri)
2017
201712. Oil content and fatty acid composition of Turkishhazelnuts (Corylus avellana L.)
GERÇEK Y. C., MORGİL H., ÇALIŞKAN M., ÖZ G.
The Third International MediterraneanSymposium onMedicinal and Aromatic Plants, 13 - 16 Nisan 2017, (Özet Bildiri)
2015
201513. Thuja orientalis L. Bitkisinin Uçucu Yağ İçeriklerinin GC-MS ile Belirlenmesi
ÖZ G., ÇALIŞKAN M., GERÇEK Y. C., Tuğcu T.
2. Ulusal botanik Kongresi, Afyon, Türkiye, 25 - 28 Ağustos 2015, cilt.1, sa.1, ss.64, (Tam Metin Bildiri)
2014
201414. Ticari Mısır Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Ürünlerin Belirlenmesi
ÖZ G., Morgil H., Ünlü Y. S., Barış D. İ., ÇALIŞKAN M.
Ulusal Botanik Kongresi, İstanbul, Türkiye, 25 - 28 Ekim 2014, ss.19, (Tam Metin Bildiri)
Kitaplar
2026
20262. Biotechnological Applications of Archaea
TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A., ARIKAN M., ÇALIŞKAN M.
Microbial World: Bacteria and Archaea, ÇALIŞKAN MAHMUT, ARIKAN MUZAFFER, Editör, Springer Nature Switzerland, İstanbul, ss.191-216, 2026
2026
20263. Microbial Omics
Erözden A. A., Tavşanlı N., Çalışkan M., Arıkan M.
Microbial World: Bacteria and Archaea, ÇALIŞKAN MAHMUT,ARIKAN MUZAFFER, Editör, Springer, Cham, London, ss.333-366, 2026
2023
20234. Genetic Diversity - Recent Advances and Applications
Çalışkan M. (Editör), Aydın S. (Editör)
IntechOpen, London, 2023
2023
20235. Hücrelerin Dokulara Dönüşmesi
Çalışkan M.
Moleküler Hücre Biyolojisi, Murat Özmen,Hikmet Geçkil,Özfer yeşilada, Editör, Palme Yayın Dağıtım, Ankara, ss.1-1184, 2023
2023
20236. Evrim Modelleri
Çalışkan M.
Evrim, Ergi Deniz Özsoy, Editör, Palme Yayın Dağıtım, Ankara, ss.1-656, 2023
2023
20237. “Omics” Technologies in Biodegradation Processes
Aydın S., Çalışkan M.
Marine Organisms: A Solution to Environmental Pollution?. Environmental Challenges and Solutions, Encarnação,T.,Canelas Pais,A., Editör, Springer, London/Berlin , Zürich, ss.1-269, 2023
2023
20238. The Diversity of Gut Bacteria and Psychological Disorders
Aydın S., Tavşanlı N., Erözden A. A., Çalışkan M.
Genetic Diversity - Recent Advances and Applications, Prof. Dr. Mahmut Çalışkan, Editör, Intech Open, London, ss.1-20, 2023
2022
20229. Genetic Polymorphisms: New Insights
Çalışkan M. (Editör), Tavşanlı N. (Editör)
IntechOpen, London, 2022
2020
202010. The Recent Topics in Genetic Polymorphisms
Çalışkan M. (Editör), Öz G. (Editör), Erol O. (Editör)
Intechopen Publication, London, 2020
2020
202011. The Recent Topics in Genetic Polymorphisms
ÇALIŞKAN M., EROL O., ÖZ G.
Intechopen Publication, 2020
2018
201812. Molecular Approaches to Genetic Diversity
ÇALIŞKAN M., ÖZ G., KAVAKLI İ. H., ÖZCAN B.
Intech, Croatia, 2018
2016
201615. Genetik Mühendisliği ve Biyoteknoloji
ÇALIŞKAN M.
Brock Mikroorganizmaların Biyolojisi, Prof. Dr. Cumhur Çökmüş, Editör, Palme Yayın Dağıtım, Ankara, ss.315-346, 2016
2016
201616. Bacteria ve Archaea Genetiği
ÇALIŞKAN M.
Brock Mikroorganizmaların Biyolojisi, Prof. Dr. Cumhur Çökmüş, Editör, Palme Yayın Dağıtım, Ankara, ss.291-314, 2016
2015
201517. Molecular Approaches to Genetic Diversity
ÇALIŞKAN M., ÖZ G., Kavaklı H., Özcan B.
A, Croatia, 2015
2011
201122. Abiotic Stress Response in Plants - Physiological, Biochemical and Genetic Perspectives
Çalışkan M.
Abiotic Stress Response in Plants - Physiological, Biochemical and Genetic Perspectives, Arun Shanker,B. Venkateswarlu, Editör, IntechOpen, London, ss.297-320, 2011
2011
201123. Hücrelerin Dokulara Dönüşmesi
ÇALIŞKAN M.
Moleküler Hücre Biyolojisi, Geçkil H, Özmen M, Yeşilada Ö, Editör, Wh Bedford, Freeman & Worth Publishing Group, Ankara, ss.801-846, 2011
2008
200824. Evrim Modelleri
ÇALIŞKAN M.
Evrim, Kence A, Bozcuk AN, Editör, Sinauer Associates, Inc. , Ankara, ss.43-65, 2008
Desteklenen Projeler
2026 - Devam Ediyor
2026 - Devam EdiyorFisetin/DOX Yüklü HA/RGD Fonksiyonelleştirilmiş Nanoparçacıkların 3B Sferoid Modellerinde Hedeflenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), ÇAKIL DÖNMEZ Y., DEMİREL G.
2025 - Devam Ediyor
2025 - Devam EdiyorMikrobiyom Araştırma Çalışmaları Kapsamında Biyoteknoloji Araştırma Laboratuvarı Altyapısı Sürekliliği Desteği
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ARIKAN M. (Yürütücü), ÇALIŞKAN M., TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A.
2025 - Devam Ediyor
2025 - Devam Ediyor
Farklı Model Organizmalarda Kanser Çoklu Omik Verilerinin Analizleri İçin Yeni Biyoinformatik Araçların Geliştirilmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), ERÖZDEN A. A.
2025 - Devam Ediyor
2025 - Devam Ediyorİstanbul Boğazındaki Mikroplastik Kirliliğinin Balık Mikrobiyomlarına Etkilerinin Entegre Multi-Omik Analizlerle İncelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ARIKAN M. (Yürütücü), MÜLAYİM A., TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A., ÇALIŞKAN M., ÇAĞLAR S.
2025 - Devam Ediyor
2025 - Devam EdiyorKriptokrom1 proteini ikincil pakete bağlanan moleküllerin sirkadiyen saat üzerine olan etkilerinin hayvan modelinde incelenmesi, preklinik çalışma
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), BARIŞ İ., KAVAKLI H., OKYAR A., ARIKAN M., ERÖZDEN A. A., et al.
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorAntibakteriyel-Biyouyumlu 3B Basılı Salyangoz Müsini-Jelatin (MüJel) Bazlı Yara Örtülerinin Üretimi ve Karakterizasyonu
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), ERÖZDEN A. A., TAVŞANLI N., DEMİREL G., ARIKAN M.
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam Ediyor
Antarktik Toprak Mikrobiyotasında Kolorektal Kanser Tedavisinde Kullanılabilecek Aday Antikanser Peptitlerin Tespiti ve In Vitro Test Edilmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ARIKAN M. (Yürütücü), ÇALIŞKAN M., TAVŞANLI N., ERÖZDEN A. A., ŞANLI N. Ö., DEMİREL G.
2024 - 2027
2024 - 2027Alfa-Sinükleinopatilerde Ortak Ve Hastalığa Özgü Konak-Mikrobiyom Ilişkilerinin Entegre Multi-Omik Analizlerle Incelenmesi
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
(Proje Özeti)
ARIKAN M. (Yürütücü), ÇALIŞKAN M., YÜCESAN E., KARACAN İ., GÜNDÜZ A., BENBİR ŞENEL G.
2025 - 2026
2025 - 2026Asya kaplan sivrisineğinde Cry toksin etkinliği ile bağırsak mikrobiyotası arasındaki ilişkinin incelenmesi
TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı
Arikan M., Çalişkan M., Erözden A. A., Tavşanli N., Gün G.
2024 - 2026
2024 - 2026Biyolojik Saati Düzenleyen Bazı Moleküllerin Kanser Hücre Hatları Üzerindeki Etkinliğinin ve Moleküler Hedeflerinin Araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora
Çalışkan M., Tavşanlı N.
2023 - 2025
2023 - 2025BMAL1in PASB alanı ve Cucu osilasyon regülatör bölgelerinde yer alan patojenik SNPlerinin BMAL1 fonksiyonuna etkilerinin incelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), AYDOĞAN S., GÜL Ş.
2023 - 2025
2023 - 2025BMAL1in bHLH ve PASA bölgelerinde yer alan patojenik SNPlerinin BMAL1 fonksiyonuna etkilerinin incelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), İZGİŞ H., GÜL Ş.
2022 - 2025
2022 - 2025
İlaç yeniden konumlandırma metoduyla biyogüvenli SARS-CoV-2 replikonu kullanılarak SARS-CoV-2 inhibitörü bulunması
TÜBİTAK Projesi , 3501 - Ulusal Genç Araştırmacı Kariyer Geliştirme Programı
Gül Ş. (Yürütücü), Topçul M. R., Çetin İ., Çalışkan M., Okyar A.
2023 - 2024
2023 - 2024İlaç Yeniden Konumlandırma Yaklaşımıyla SARSCoV2 Virüsüne Karşı In Vitro Yöntemlerle İlaç Tasarımı
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), GÜL Ş., ORUÇOĞLU B.
2023 - 2024
2023 - 2024
Jelatin/Aljinat/Hiyalüronik Asit ile Oluşturulan İskelede Karaciğer Dokusunun Morfolojik Özelliklerinin Araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
Çalışkan M. (Yürütücü), Aktaş R. G., Demirel G.
2022 - 2024
2022 - 2024Kriptokrom1 ikincil pakete bağlanan moleküllerin sirkadiyen saat üzerine olan etkilerinin incelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), KAVAKLI İ. H., GÜL Ş., KAVAKLI H.
2022 - 2024
2022 - 2024
Crizotinibin Monoterapi ve Bütirik Asit ile Kombin Terapi Olarak Kullanımının Farklı Meme Kanseri Hücreleri Üzerindeki Etkilerinin Karşılaştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
TOPÇUL M. R. (Yürütücü), ÇALIŞKAN M., ÇETİN İ., PULAT E.
2022 - 2024
2022 - 2024Patojenik BMAL1 SNP'lerinin Sirkadiyen Saat Mekanizmasına Etksinin Belirlenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), KAVAKLI İ. H., GÜL Ş.
2022 - 2024
2022 - 2024Green All Together
Erasmus Projesi , Erasmus+ KA2 Yenilik ve İyi Uygulamaların Değişimi için İşbirliği Projesi, Ulusal Düzey
Aydın S. (Yürütücü), Çalışkan M., Tavşanlı N., Erözden A. A.
2019 - 2024
2019 - 2024Giresun ve Çevresinde Yayılış Gösteren Kiraz Gen Kaynaklarının Fitokimyasal Analizleri Antioksidan Aktivitelerinin Tayin Edilmesi ve İn Vitro Biyoyararlılığının İncelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), MORGİL H., TOYDEMİR G., ÇAPANOĞLU GÜVEN E., ÖZ G., GERÇEK Y. C., et al.
2018 - 2022
2018 - 2022Embriyonik Fibroblast Hücrelerinde Arsenikle İndüklenmiş Genotoksik Ve Apoptotik Mekanizmalar Üzerine N-asetilsisteinin Etkileri
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), ERKAN M. B., TAŞÇİ T.
2019 - 2020
2019 - 2020
Gliotoksin'in Farklı Meme Kanseri Hücre Hatlarındaki Kinetik Etkilerinin Değerlendirilmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), AKKÜLAH ŞENOL G.
2016 - 2020
2016 - 2020Türkiye’de Yayılış Gösteren Cerasus L. (Rosaceae) Cinsi Taksonları Üzerinde Moleküler Sistematik ve Fitokimyasal Çalışmalar
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Erol O.(Yürütücü), Öz G., Öztürk B., Çalışkan M., Yaprak A. E., Şık L., et al.
2019 - 2019
2019 - 2019Carbohydrate
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), KAVAKLI H., ÖZ G.
2016 - 2018
2016 - 2018
Kuraklık Stresi Altında Yetiştirilen Mercimek Lens culinaris Medik Bitkisinde
Transkriptom (RNA-sek) Analizi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Güdümlü
ÖZ G. (Yürütücü), ÇALIŞKAN M., MORGİL H., GERÇEK Y. C., KAVAKLI H.
2017 - 2017
2017 - 2017Molecular Approaches to Genetic Diversity
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü), ÖZ G., ÖZCAN B., KAVAKLI İ. H.
2011 - 2012
2011 - 2012İmmobilize edilmiş halofilik arke izolatlarının hidrolitik enzim aktivitelerinin belirlenmesi
TÜBİTAK Projesi
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü)
2005 - 2008
2005 - 2008Mercimekte (Lens culinaris Medic.) nişaşta sentezinde görev alan cDNA genlerinin izolasyonu ve karakterizasyonu
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Kavaklı İ. H.(Yürütücü), Çalışkan M.
2005 - 2008
2005 - 2008Oksalik asit metabolizmasının enzimatik, immünolojik ve moleküler genetik yöntemler ile araştırılması
TÜBİTAK Projesi
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü)
2006 - 2007
2006 - 2007Hatay bölgesindeki orak hücre anemili hastalarda MTHFR geninin C677T polimorfizminin araştırılması
TÜBİTAK Projesi
ÇALIŞKAN M. (Yürütücü)
2005 - 2007
2005 - 2007AKDENİZ, EGE, MARMARA VE KARADENİZ DE BULUNAN İSTAVRİT TÜRLERİ (TRACHURUS SPP.) POPULASYONLARININ GENETİK YAPI ANALİZİ VE FİLOGENETİK İLİŞKİLERİNİN BELİRLENMESİ
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Turan C.(Yürütücü), Öztürk B., Çalışkan M.
2005 - 2006
2005 - 2006Türkiye’den izole edilen halofilik arkebakterilerin polar lipit profillerinin ve hücre morfolojilerinin belirlenmesi
TÜBİTAK Projesi
ÇALIŞKAN M.
2004 - 2005
2004 - 2005Halofilik arkebakteri izolatlarının morfolojik özellikleri ve antibiyotiklere duyarlılıklarının belirlenmesi
TÜBİTAK Projesi
ÇALIŞKAN M.
Bilimsel Dergilerdeki Faaliyetler
2015 - Devam Ediyor
2015 - Devam EdiyorEuropean Journal of Biology
Editörler Kurulu Üyesi
Bilimsel Yayınlarda Hakemlikler
Mayıs 2015
Mayıs 2015European Journal of Biology
Diğer Dergiler
Ödüller
Burslar
2004 - 2004
2004 - 2004NATO B2 Yurt Dışı Doktora Sonrası Araştırma Bursu
TÜBİTAK
1993 - 1998
1993 - 1998Yurt Dışı Doktora Bursu
YÖK
Atıflar
Toplam Atıf Sayısı (WOS): 538
h-indeksi (WOS): 13
Jüri Üyelikleri
Haziran-2008
Haziran 2008Tez Savunma (Doktora)
- Çeşitli Üniversiteler
Haziran-2007
Haziran 2007Doçentlik Sınavı
- Çeşitli Üniversiteler
Haziran-2001
Haziran 2001Akademik Kadroya Atama-Yardımcı Doçentlik
- Çeşitli Üniversiteler
Haziran-2000
Haziran 2000